More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1158 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
298 aa  594  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
298 aa  594  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  99.33 
 
 
298 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  99.33 
 
 
298 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  99.33 
 
 
298 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  99.33 
 
 
298 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  99.33 
 
 
298 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  92.57 
 
 
306 aa  545  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  79.59 
 
 
296 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  80.95 
 
 
294 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  78.57 
 
 
296 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  77.63 
 
 
296 aa  463  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  77.21 
 
 
296 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  79.93 
 
 
296 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  79.93 
 
 
296 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  79.93 
 
 
296 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  70.85 
 
 
296 aa  431  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  52.1 
 
 
298 aa  294  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  51.24 
 
 
302 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  41.55 
 
 
305 aa  208  8e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  39.86 
 
 
350 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  41.32 
 
 
299 aa  206  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  41.13 
 
 
350 aa  198  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 
293 aa  198  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  43.71 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  39.16 
 
 
346 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  39.66 
 
 
305 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  38.87 
 
 
347 aa  185  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  37.73 
 
 
341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  38.6 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 
343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 
343 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  37.81 
 
 
349 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 
344 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  37.81 
 
 
336 aa  182  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  35.82 
 
 
337 aa  182  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  37.59 
 
 
341 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  37.81 
 
 
348 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  39.72 
 
 
304 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 
345 aa  179  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 
347 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  36.17 
 
 
340 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  35.69 
 
 
347 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 
347 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  38.11 
 
 
352 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 
350 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  39.16 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 
354 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  36.65 
 
 
347 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  41.61 
 
 
308 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  36.97 
 
 
350 aa  171  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  36.17 
 
 
347 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  35.46 
 
 
346 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  38.32 
 
 
349 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  38.6 
 
 
305 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  36.27 
 
 
364 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  38.38 
 
 
354 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  38.01 
 
 
348 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  34.51 
 
 
347 aa  168  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 
346 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  35.94 
 
 
341 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 
346 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 
347 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  35.23 
 
 
345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  39.32 
 
 
296 aa  165  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  34.98 
 
 
347 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  38.25 
 
 
456 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  36.52 
 
 
444 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  36.52 
 
 
453 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  38.54 
 
 
356 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  32.51 
 
 
347 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 
305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 
305 aa  129  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1116  alpha/beta hydrolase  65.35 
 
 
236 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.500827  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11147  epoxide hydrolase ephC  29.52 
 
 
316 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  32.98 
 
 
300 aa  96.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540254  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  34.06 
 
 
308 aa  96.7  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
287 aa  95.5  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  30.96 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4086  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 
300 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4162  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 
300 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.573182  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4316  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 
300 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
281 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  27.7 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0714  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0301539  normal  0.0245198 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0191  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
349 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  34.45 
 
 
287 aa  79  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2990  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 
322 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  hitchhiker  0.00172435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  29.24 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.27 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>