235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1116 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1116  alpha/beta hydrolase  100 
 
 
236 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.500827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  74.26 
 
 
296 aa  148  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  69.31 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  66.34 
 
 
296 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  67.33 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  65.35 
 
 
296 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  65.35 
 
 
296 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  63.37 
 
 
296 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  63.37 
 
 
296 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  65.35 
 
 
298 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  65.35 
 
 
298 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  65.35 
 
 
298 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  65.35 
 
 
298 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  65.35 
 
 
298 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  65.35 
 
 
298 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  65.35 
 
 
298 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  63.37 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  65.35 
 
 
294 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  43.96 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  42.71 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  42.99 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  40.66 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  40.66 
 
 
456 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  40.66 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  40.66 
 
 
453 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  40.86 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  35.16 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  37.39 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  42.86 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  42.99 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 
348 aa  68.6  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  39.56 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  36.96 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 
364 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  41.11 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  42.22 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  37.36 
 
 
347 aa  65.5  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  39.56 
 
 
336 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 
354 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 
293 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  37.78 
 
 
340 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  37.78 
 
 
347 aa  62  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  36.26 
 
 
349 aa  62  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  29.78 
 
 
302 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 
350 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
347 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  35.56 
 
 
347 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  34.23 
 
 
334 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 
347 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 
346 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  35.87 
 
 
346 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 
346 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 
347 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  36.67 
 
 
349 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  43.93 
 
 
293 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  35.16 
 
 
350 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 
345 aa  58.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  34.07 
 
 
352 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 
354 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 
340 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
310 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  42.99 
 
 
307 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
310 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
331 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  37.36 
 
 
341 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 
338 aa  55.5  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  38.39 
 
 
305 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  36.84 
 
 
348 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4742  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 
278 aa  52  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  39.53 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 
277 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  39.81 
 
 
334 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 
323 aa  50.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
331 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7042  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 
278 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.167796  normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1450  alpha/beta hydrolase fold  30.84 
 
 
278 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 
273 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6378  alpha/beta hydrolase fold  30.84 
 
 
278 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  38.76 
 
 
356 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
343 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  33.98 
 
 
877 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
277 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2990  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
278 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
277 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 
306 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4894  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
278 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 
306 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
277 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5376  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
278 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  38.71 
 
 
279 aa  48.9  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
314 aa  48.5  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 
317 aa  48.9  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  36.46 
 
 
272 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 
269 aa  48.5  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>