More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5052 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  100 
 
 		 352 aa  720    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  85.43 
 
 		 350 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  71.23 
 
 		 344 aa  521  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  71.23 
 
 		 349 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  69.36 
 
 		 348 aa  503  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  64.1 
 
 		 343 aa  482  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  64.1 
 
 		 343 aa  481  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  64.86 
 
 		 350 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  64.29 
 
 		 347 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  64.57 
 
 		 347 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  64.45 
 
 		 354 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  63.82 
 
 		 347 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  66.18 
 
 		 346 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  64.86 
 
 		 341 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  62.11 
 
 		 337 aa  465  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  63.53 
 
 		 350 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  65.79 
 
 		 345 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  69.1 
 
 		 347 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  67.25 
 
 		 340 aa  458  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  63.93 
 
 		 349 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  63.53 
 
 		 341 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  64.47 
 
 		 348 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  63.8 
 
 		 341 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  63.82 
 
 		 347 aa  451  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  62.5 
 
 		 346 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  63.04 
 
 		 347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  63.71 
 
 		 346 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  64.1 
 
 		 347 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  63.43 
 
 		 346 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  62.36 
 
 		 350 aa  437  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  60.12 
 
 		 347 aa  434  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  59.15 
 
 		 354 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  63.69 
 
 		 453 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  63.69 
 
 		 456 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  63.69 
 
 		 444 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  62.22 
 
 		 345 aa  418  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  59.83 
 
 		 347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  59.8 
 
 		 347 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  60.63 
 
 		 364 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  57.53 
 
 		 336 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  55.93 
 
 		 308 aa  343  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  53.92 
 
 		 307 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  53.02 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  52.9 
 
 		 305 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  49.66 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  50.69 
 
 		 293 aa  279  6e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  49.32 
 
 		 305 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  50.17 
 
 		 296 aa  269  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  45.76 
 
 		 305 aa  262  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  44.78 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  48.62 
 
 		 308 aa  259  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  41.38 
 
 		 302 aa  213  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  39.93 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  39.52 
 
 		 296 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  38.54 
 
 		 296 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  38.16 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  38.46 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  38.46 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  38.46 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  38.46 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  38.46 
 
 		 298 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  38.11 
 
 		 298 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  38.11 
 
 		 298 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  36.81 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  39.93 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  39.58 
 
 		 296 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  39.24 
 
 		 296 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  39.24 
 
 		 296 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  37.32 
 
 		 306 aa  171  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 		 293 aa  166  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  36.24 
 
 		 296 aa  166  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  30.13 
 
 		 308 aa  89.7  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  32.06 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  34.5 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  46.23 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  37.33 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  41.44 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  41.44 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  35.67 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  41.07 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  37.98 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  32.26 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4086  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4162  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.573182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4316  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  41.46 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  36.29 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  34.21 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>