More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4736 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
350 aa  717    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  85.43 
 
 
352 aa  620  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  68.97 
 
 
344 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  68.68 
 
 
349 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  67.24 
 
 
348 aa  490  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  66.38 
 
 
350 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  63.98 
 
 
350 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  63.98 
 
 
343 aa  475  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  64.86 
 
 
347 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  63.69 
 
 
343 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  64.47 
 
 
347 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  66.76 
 
 
346 aa  472  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  64.71 
 
 
354 aa  461  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  63.35 
 
 
347 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  65.66 
 
 
349 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  64.81 
 
 
345 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  64.76 
 
 
347 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  63.51 
 
 
341 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  65.42 
 
 
347 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  67.16 
 
 
340 aa  451  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  66.37 
 
 
348 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  61.32 
 
 
337 aa  448  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  63.88 
 
 
341 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  62.54 
 
 
341 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  62.25 
 
 
347 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  61.93 
 
 
350 aa  443  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  65.8 
 
 
347 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  63.53 
 
 
346 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  63.22 
 
 
346 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  62.93 
 
 
346 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  60.4 
 
 
354 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  62.61 
 
 
456 aa  424  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  62.61 
 
 
453 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  62.61 
 
 
444 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  58.64 
 
 
345 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  57.76 
 
 
347 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  59.08 
 
 
347 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  60.47 
 
 
347 aa  396  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  61.27 
 
 
364 aa  388  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  58.02 
 
 
308 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  56.8 
 
 
336 aa  350  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  54.61 
 
 
307 aa  306  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  49.71 
 
 
356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  52.56 
 
 
305 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  50.34 
 
 
293 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  51.02 
 
 
296 aa  272  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  48.46 
 
 
304 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  48.63 
 
 
305 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  46.15 
 
 
299 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  44.75 
 
 
305 aa  255  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  47.93 
 
 
308 aa  253  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  41.72 
 
 
302 aa  209  8e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 
298 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 
310 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 
310 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  36.81 
 
 
296 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  36.88 
 
 
296 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  36.88 
 
 
296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  36.97 
 
 
298 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  36.97 
 
 
298 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  36.97 
 
 
298 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  36.97 
 
 
298 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  36.97 
 
 
298 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  36.97 
 
 
298 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  36.97 
 
 
298 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  37.63 
 
 
294 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  35.69 
 
 
306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  35.76 
 
 
296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 
296 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 
296 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 
296 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  36.17 
 
 
296 aa  162  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  33.69 
 
 
293 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
305 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  31.55 
 
 
287 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  35.88 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  35.88 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  34.97 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  37.76 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.4 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  35.71 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  33.11 
 
 
356 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 
324 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01260  haloalkane dehalogenase  33.33 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.754797  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  36.09 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  35.22 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  39.52 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11147  epoxide hydrolase ephC  25.17 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 
293 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  31.88 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  34.85 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
323 aa  69.3  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>