More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2687 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  100 
 
 
305 aa  623  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  70.55 
 
 
296 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  65.98 
 
 
307 aa  378  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  64.36 
 
 
293 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  60.14 
 
 
308 aa  358  4e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  58.76 
 
 
305 aa  345  5e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  56.51 
 
 
299 aa  341  7e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  58.75 
 
 
308 aa  340  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  58.36 
 
 
304 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  56.21 
 
 
305 aa  333  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  59.45 
 
 
356 aa  322  6e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  53.92 
 
 
341 aa  318  6e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  54.45 
 
 
347 aa  317  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  53.24 
 
 
347 aa  316  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  52.9 
 
 
347 aa  315  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  53.08 
 
 
343 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  53.08 
 
 
343 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  52.56 
 
 
347 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  52.56 
 
 
344 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  54.9 
 
 
349 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  52.9 
 
 
347 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  53.93 
 
 
341 aa  309  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  52.56 
 
 
350 aa  309  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  52.9 
 
 
352 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  49.83 
 
 
337 aa  308  9e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  51.88 
 
 
354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  53.04 
 
 
348 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  51.88 
 
 
346 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  52.23 
 
 
348 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  51.53 
 
 
350 aa  306  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  52.4 
 
 
347 aa  305  7e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  53.1 
 
 
350 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  51.86 
 
 
345 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  51.88 
 
 
349 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  52.05 
 
 
340 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  52.23 
 
 
345 aa  302  6.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  47.6 
 
 
347 aa  301  7.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  49.32 
 
 
354 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  52.56 
 
 
347 aa  299  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  49.66 
 
 
350 aa  299  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  52.33 
 
 
347 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  51.54 
 
 
346 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  51.19 
 
 
346 aa  298  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  51.71 
 
 
341 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  49.31 
 
 
346 aa  296  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  50.34 
 
 
336 aa  292  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  47.46 
 
 
347 aa  287  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  52.41 
 
 
456 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  52.41 
 
 
453 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  52.41 
 
 
444 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  46.92 
 
 
364 aa  274  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  37.85 
 
 
310 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  37.85 
 
 
310 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  40.69 
 
 
302 aa  205  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  39.45 
 
 
296 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  39.12 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  37.23 
 
 
298 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  38.6 
 
 
298 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  38.6 
 
 
298 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  38.6 
 
 
298 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  38.41 
 
 
298 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  38.6 
 
 
298 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  38.6 
 
 
296 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  38.6 
 
 
298 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  38.6 
 
 
298 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  40.48 
 
 
294 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  38.6 
 
 
296 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  37.11 
 
 
296 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  40.7 
 
 
296 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  40.7 
 
 
296 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  40.7 
 
 
296 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  37.28 
 
 
296 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 
293 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 
305 aa  126  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 
287 aa  112  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  32.16 
 
 
294 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
274 aa  84  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  39.85 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  44.55 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 
287 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  27.49 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.22 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11147  epoxide hydrolase ephC  27.08 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  39.09 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.06 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  34.75 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
291 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>