More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1870 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 296 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 296 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  98.31 
 
 		 296 aa  583  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  89.53 
 
 		 296 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  88.85 
 
 		 296 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  92.49 
 
 		 294 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  87.12 
 
 		 296 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  80.2 
 
 		 298 aa  474  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  79.59 
 
 		 298 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  79.93 
 
 		 298 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  80.82 
 
 		 306 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  79.59 
 
 		 298 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  79.93 
 
 		 298 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  79.59 
 
 		 298 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  79.59 
 
 		 298 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  73.99 
 
 		 296 aa  437  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  69.93 
 
 		 296 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  48.63 
 
 		 298 aa  285  8e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  53.19 
 
 		 302 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  40.48 
 
 		 310 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  40.48 
 
 		 310 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  42.01 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  41.55 
 
 		 305 aa  208  9e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  38.68 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  40.28 
 
 		 350 aa  201  9e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  43.62 
 
 		 293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  40.27 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  40.14 
 
 		 346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  41.13 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  41.7 
 
 		 350 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  40.2 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  37.81 
 
 		 337 aa  187  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  39.24 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  39.01 
 
 		 336 aa  186  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  40.07 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  37.94 
 
 		 347 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  39.22 
 
 		 349 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  42.2 
 
 		 308 aa  185  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  37.59 
 
 		 347 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  37.81 
 
 		 344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  39.19 
 
 		 341 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  37.59 
 
 		 347 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  37.29 
 
 		 350 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  38.52 
 
 		 348 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  38.3 
 
 		 347 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  38.41 
 
 		 347 aa  178  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  40.7 
 
 		 305 aa  178  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  36.9 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  37.37 
 
 		 354 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  37.28 
 
 		 341 aa  176  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  41.16 
 
 		 296 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  37.46 
 
 		 364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  37.59 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  37.23 
 
 		 350 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  36.88 
 
 		 346 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  39.1 
 
 		 348 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  36.81 
 
 		 347 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  36.27 
 
 		 347 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 		 346 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  37.68 
 
 		 340 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 354 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  35.21 
 
 		 347 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  37.94 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  38.3 
 
 		 456 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  38.3 
 
 		 453 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  38.3 
 
 		 444 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  35.59 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 		 341 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  38.24 
 
 		 349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  37.85 
 
 		 356 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  34.97 
 
 		 305 aa  135  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1116  alpha/beta hydrolase  65.35 
 
 		 236 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.500827  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11147  epoxide hydrolase ephC  31.54 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 		 281 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 		 308 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 307 aa  92.4  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4316  alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 		 300 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4086  alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 		 300 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4162  alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 		 300 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.573182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3248  EphC  32.31 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0191  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2990  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  hitchhiker  0.00172435 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  34.76 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>