More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2274 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
293 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  63.7 
 
 
304 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  62.46 
 
 
305 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  63.48 
 
 
307 aa  359  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  60.07 
 
 
299 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  64.36 
 
 
305 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  57.68 
 
 
308 aa  335  7.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  62.33 
 
 
308 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  58.9 
 
 
296 aa  316  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  54.7 
 
 
305 aa  305  7e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  52.41 
 
 
346 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  57.34 
 
 
356 aa  298  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  52.41 
 
 
347 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 
340 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  49.31 
 
 
343 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  50.69 
 
 
352 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  49.31 
 
 
343 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
344 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  48.62 
 
 
337 aa  285  8e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  48.62 
 
 
347 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  49.66 
 
 
354 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  49.66 
 
 
349 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  50.34 
 
 
350 aa  281  9e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  49.31 
 
 
341 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  49.66 
 
 
347 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  49.31 
 
 
345 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  49.31 
 
 
348 aa  279  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  52.45 
 
 
349 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  49.66 
 
 
347 aa  279  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  49.66 
 
 
350 aa  279  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  48.97 
 
 
347 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  49.31 
 
 
347 aa  278  7e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  50.69 
 
 
348 aa  278  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  48.62 
 
 
350 aa  278  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 
345 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  48.4 
 
 
341 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  47.8 
 
 
364 aa  276  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  48.1 
 
 
354 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  50.69 
 
 
346 aa  275  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  45.67 
 
 
347 aa  275  7e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  50.34 
 
 
346 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  48.44 
 
 
336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  52.76 
 
 
456 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  47.93 
 
 
350 aa  273  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  51.03 
 
 
347 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  51.2 
 
 
347 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  52.76 
 
 
453 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  52.76 
 
 
444 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  48.1 
 
 
346 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  49.31 
 
 
341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  44.52 
 
 
347 aa  255  5e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  42.76 
 
 
310 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  42.76 
 
 
310 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  46.21 
 
 
302 aa  229  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  44.91 
 
 
296 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  45.58 
 
 
296 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  44.88 
 
 
296 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  45.74 
 
 
294 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  45.3 
 
 
306 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  44.6 
 
 
298 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  44.6 
 
 
298 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  44.25 
 
 
298 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  43.9 
 
 
298 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  43.9 
 
 
298 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  43.9 
 
 
298 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  43.9 
 
 
298 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  43.62 
 
 
296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  43.62 
 
 
296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  43.62 
 
 
296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  39.22 
 
 
298 aa  199  6e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  42.51 
 
 
296 aa  198  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  43.46 
 
 
296 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
293 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 
305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 
305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
287 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  30.69 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  33.1 
 
 
294 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  35.05 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2917  alpha/beta hydrolase  30.1 
 
 
295 aa  79  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  43.24 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
288 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3248  EphC  33.1 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4021  alpha/beta hydrolase fold  40.52 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.655043  normal  0.26756 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  30.63 
 
 
494 aa  72.8  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4764  alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0496  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0507  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.697131 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0485  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.891583  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  30.03 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  40.18 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>