More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1476 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 345 aa  701    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  66.57 
 
 		 344 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  64.12 
 
 		 341 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  69.13 
 
 		 347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  64.52 
 
 		 340 aa  445  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  69.46 
 
 		 349 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  70.61 
 
 		 350 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  69.02 
 
 		 354 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  61.81 
 
 		 337 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  59.77 
 
 		 343 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  64.67 
 
 		 348 aa  431  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  59.48 
 
 		 343 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  62.2 
 
 		 341 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  65.81 
 
 		 346 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  64.33 
 
 		 349 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  62.22 
 
 		 352 aa  418  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  59.83 
 
 		 350 aa  420  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  60.18 
 
 		 347 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  63.02 
 
 		 350 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  60.18 
 
 		 347 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  59.88 
 
 		 347 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  62.5 
 
 		 348 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  58.82 
 
 		 341 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  63.97 
 
 		 347 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  57.51 
 
 		 346 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  58.29 
 
 		 350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  66.33 
 
 		 347 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  64.77 
 
 		 347 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  57.53 
 
 		 345 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  61.1 
 
 		 347 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  64.77 
 
 		 453 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  65.42 
 
 		 444 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  60.95 
 
 		 346 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  64.77 
 
 		 456 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  60.36 
 
 		 346 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  56.74 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  54.15 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  56.04 
 
 		 347 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  57.76 
 
 		 364 aa  358  7e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  56.46 
 
 		 336 aa  344  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  50.68 
 
 		 308 aa  300  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  53.36 
 
 		 296 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  51.71 
 
 		 305 aa  288  8e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  50.17 
 
 		 307 aa  285  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  51.88 
 
 		 305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  48.99 
 
 		 305 aa  283  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  49.31 
 
 		 293 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  50.17 
 
 		 304 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  48.14 
 
 		 308 aa  267  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  46.44 
 
 		 299 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  47.06 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  38.72 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  38.72 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  38.78 
 
 		 302 aa  199  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  35.84 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  38.95 
 
 		 296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  37.46 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  37.46 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  37.46 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  37.46 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  37.46 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  37.46 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  37.11 
 
 		 298 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  37.85 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  37.32 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  36.97 
 
 		 306 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  37.41 
 
 		 296 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 		 296 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  36.9 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  36.9 
 
 		 296 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  36.9 
 
 		 296 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  35.86 
 
 		 294 aa  165  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 287 aa  90.9  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  34.16 
 
 		 307 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 270 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  31.44 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  31.22 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  30.32 
 
 		 494 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  36.2 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  28.49 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  32.61 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 288 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  37.6 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  37.98 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  37.98 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.93 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40.87 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>