More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4005 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
347 aa  713    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  66.24 
 
 
343 aa  421  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  67.46 
 
 
343 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  61.21 
 
 
337 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  65.41 
 
 
336 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  66.33 
 
 
350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  64.43 
 
 
347 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  61.71 
 
 
344 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  62.06 
 
 
347 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  63.76 
 
 
347 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  65.07 
 
 
347 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  62.08 
 
 
350 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  60.47 
 
 
350 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  58.26 
 
 
354 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  64.94 
 
 
341 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  62.71 
 
 
350 aa  395  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  64.89 
 
 
341 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  61.74 
 
 
347 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  58.33 
 
 
349 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  59.12 
 
 
354 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  62.08 
 
 
346 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  61.41 
 
 
348 aa  391  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  59.8 
 
 
352 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  58.95 
 
 
347 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  62.21 
 
 
347 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  62.42 
 
 
346 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  55.49 
 
 
346 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  61.56 
 
 
340 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  56.57 
 
 
341 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  61.82 
 
 
349 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  61.36 
 
 
346 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  64.75 
 
 
453 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  61.36 
 
 
347 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  64.75 
 
 
456 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  64.75 
 
 
444 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  59.79 
 
 
345 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  61.67 
 
 
347 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  56.04 
 
 
345 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  56.49 
 
 
348 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  56.33 
 
 
364 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  49.66 
 
 
308 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  47.77 
 
 
307 aa  292  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  47.46 
 
 
356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  47.77 
 
 
296 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  47.6 
 
 
305 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  48.29 
 
 
304 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  44.18 
 
 
305 aa  273  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  44.48 
 
 
305 aa  273  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  45.67 
 
 
293 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  44.01 
 
 
299 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  43.1 
 
 
308 aa  253  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  41.34 
 
 
298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  34.2 
 
 
310 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  34.2 
 
 
310 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  35.05 
 
 
302 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  33.1 
 
 
296 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  32.51 
 
 
306 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  32.75 
 
 
296 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  32.51 
 
 
298 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  32.51 
 
 
298 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  32.51 
 
 
298 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  32.51 
 
 
298 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  32.51 
 
 
298 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  32.51 
 
 
298 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  32.51 
 
 
298 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 
296 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 
296 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 
296 aa  146  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 
296 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 
296 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  30.27 
 
 
294 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 
296 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
305 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
294 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
276 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  26.88 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  36.75 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  35.54 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  34.92 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
341 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  33.88 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 
331 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  23.84 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  27.62 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.29 
 
 
639 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  35.59 
 
 
290 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4800  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176635  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>