60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0390 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0390  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  659    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.752733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  51.83 
 
 
324 aa  311  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  50.66 
 
 
324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  49.34 
 
 
319 aa  295  7e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  49.68 
 
 
322 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2084  hypothetical protein  42.9 
 
 
322 aa  259  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  46.02 
 
 
309 aa  256  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  45.17 
 
 
309 aa  246  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  43.1 
 
 
297 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  40.48 
 
 
308 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2206  hypothetical protein  40.91 
 
 
336 aa  185  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  26.06 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  32.8 
 
 
568 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  31.9 
 
 
300 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  31.25 
 
 
607 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1126  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.4 
 
 
350 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.61 
 
 
350 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  29.33 
 
 
567 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  29.38 
 
 
347 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  30.66 
 
 
565 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.48 
 
 
688 aa  51.2  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  31.4 
 
 
345 aa  50.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  31.39 
 
 
649 aa  49.3  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  27.59 
 
 
547 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.85 
 
 
361 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.3 
 
 
396 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  31.62 
 
 
347 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.57 
 
 
705 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  27.94 
 
 
526 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  28 
 
 
543 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.14 
 
 
631 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  26.23 
 
 
601 aa  47.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.33 
 
 
330 aa  47  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  29.51 
 
 
533 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  25.41 
 
 
318 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  26.52 
 
 
318 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  25.41 
 
 
318 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.81 
 
 
645 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.81 
 
 
645 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.09 
 
 
645 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  26.23 
 
 
567 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  27.88 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  30.09 
 
 
568 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  25.9 
 
 
546 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  26.67 
 
 
572 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  26.58 
 
 
634 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  28.23 
 
 
365 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  28.45 
 
 
328 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  27.14 
 
 
498 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.93 
 
 
665 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.1 
 
 
642 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  28.26 
 
 
369 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  28.57 
 
 
369 aa  43.1  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.33 
 
 
644 aa  43.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.63 
 
 
642 aa  43.1  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  28.07 
 
 
551 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.61 
 
 
629 aa  42.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1426  hypothetical protein  23.04 
 
 
302 aa  42.7  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0485353  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2227  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.97 
 
 
488 aa  42.7  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  26.05 
 
 
572 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>