52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2206 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2206  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  667    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  56.83 
 
 		 308 aa  317  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  58.42 
 
 		 309 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  57.46 
 
 		 309 aa  305  6e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  55.3 
 
 		 297 aa  290  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  45.52 
 
 		 324 aa  230  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  44.56 
 
 		 324 aa  226  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  49.43 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  43.3 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2084  hypothetical protein  45.45 
 
 		 322 aa  199  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0390  hypothetical protein  40.91 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.752733 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  26.64 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  35.65 
 
 		 568 aa  56.2  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  32.77 
 
 		 567 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  30.28 
 
 		 568 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  27.93 
 
 		 547 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  24.39 
 
 		 551 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  30.14 
 
 		 361 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  31.29 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  31.03 
 
 		 572 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  25.34 
 
 		 607 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.12 
 
 		 350 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  30.36 
 
 		 572 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1126  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.69 
 
 		 350 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  32.23 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  27.35 
 
 		 565 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  26.92 
 
 		 464 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  21.96 
 
 		 543 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.77 
 
 		 396 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  26.46 
 
 		 348 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.38 
 
 		 688 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  25 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.43 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.15 
 
 		 631 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.75 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4730  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.788247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  24.91 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  33.33 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  25.87 
 
 		 567 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  31.62 
 
 		 526 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  26.46 
 
 		 348 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  32.14 
 
 		 327 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3968  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  30.4 
 
 		 735 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.507879  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  23.71 
 
 		 369 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  30 
 
 		 382 aa  43.5  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00782  Dipeptidyl peptidase IV  32.69 
 
 		 741 aa  43.5  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0118527  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  26.75 
 
 		 339 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  25.97 
 
 		 348 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1203  dienelactone hydrolase  33.65 
 
 		 261 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  24.56 
 
 		 605 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.47 
 
 		 629 aa  42.7  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>