67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4327 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  626  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  79 
 
 
324 aa  504  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  77.04 
 
 
324 aa  490  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  68.05 
 
 
322 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  57.38 
 
 
309 aa  328  7e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  55.59 
 
 
309 aa  322  5e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2084  hypothetical protein  53.75 
 
 
322 aa  309  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0390  hypothetical protein  49.34 
 
 
318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.752733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  55.59 
 
 
297 aa  303  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  50.32 
 
 
308 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2206  hypothetical protein  43.71 
 
 
336 aa  205  7e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1126  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.41 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  30.13 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  26.04 
 
 
565 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  32.67 
 
 
361 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  37.82 
 
 
568 aa  63.5  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  35.59 
 
 
607 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  36 
 
 
365 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  28.21 
 
 
464 aa  56.2  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  27.05 
 
 
430 aa  55.8  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  33.88 
 
 
572 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  36.43 
 
 
345 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  24.45 
 
 
543 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  27.52 
 
 
313 aa  53.9  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  30.34 
 
 
338 aa  53.5  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  34.71 
 
 
572 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  31.9 
 
 
347 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  23.84 
 
 
569 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  31.71 
 
 
298 aa  52.8  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  29.75 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.45 
 
 
382 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  33.33 
 
 
526 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  28.57 
 
 
601 aa  50.4  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  34.82 
 
 
347 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  27.74 
 
 
342 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  26.42 
 
 
567 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  33.9 
 
 
328 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  26.5 
 
 
551 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  29.58 
 
 
547 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  26.43 
 
 
546 aa  49.3  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  34.51 
 
 
343 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  26.76 
 
 
567 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  29.37 
 
 
568 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  32.26 
 
 
337 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  30.37 
 
 
300 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.47 
 
 
406 aa  47.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  29.26 
 
 
254 aa  46.6  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  29.46 
 
 
318 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  29.46 
 
 
318 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  23.69 
 
 
600 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  23.69 
 
 
600 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  27.48 
 
 
318 aa  46.2  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  35.48 
 
 
352 aa  45.8  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  30.83 
 
 
545 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.92 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  33.33 
 
 
374 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  24.84 
 
 
456 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  29.29 
 
 
334 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  23.15 
 
 
449 aa  43.9  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0883  triacylglycerol lipase  28.26 
 
 
301 aa  43.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613439  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  30.56 
 
 
330 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  24.62 
 
 
449 aa  43.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  25.41 
 
 
605 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  35.45 
 
 
342 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  36.36 
 
 
339 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30181  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.37 
 
 
505 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.157772 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  26.09 
 
 
456 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>