31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1192 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1192  hypothetical protein  100 
 
 		 866 aa  1737    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2934  hypothetical protein  41.75 
 
 		 827 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2693  hypothetical protein  42.82 
 
 		 827 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000315404  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1673  hypothetical protein  42.59 
 
 		 827 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000708466  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2791  hypothetical protein  42.71 
 
 		 827 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000777581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2714  hypothetical protein  42.71 
 
 		 827 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000160154  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1693  hypothetical protein  42.83 
 
 		 828 aa  570  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000331771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2408  hypothetical protein  42.71 
 
 		 828 aa  571  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0178589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2395  hypothetical protein  41.39 
 
 		 824 aa  558  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000022798  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1529  hypothetical protein  42.05 
 
 		 828 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00333125  hitchhiker  0.00000000514631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1469  hypothetical protein  41.64 
 
 		 827 aa  554  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000892624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1535  hypothetical protein  41.48 
 
 		 828 aa  548  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000356269  hitchhiker  0.00903713 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2904  hypothetical protein  41.57 
 
 		 823 aa  538  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000289565  normal  0.061749 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2472  hypothetical protein  40 
 
 		 839 aa  535  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00113127  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2571  hypothetical protein  42.59 
 
 		 829 aa  524  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2120  hypothetical protein  42.21 
 
 		 826 aa  521  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000487086  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1650  hypothetical protein  40.25 
 
 		 832 aa  510  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000305835  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01894  hypothetical protein  37.41 
 
 		 856 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.128925  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2182  hypothetical protein  35.71 
 
 		 872 aa  219  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000870738  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05818  extracellular lipase  29.35 
 
 		 826 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0373  putative lipase  27.63 
 
 		 796 aa  201  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000184  putative lipase  27.32 
 
 		 802 aa  191  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00112998  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1215  MECDP-synthase  27.94 
 
 		 993 aa  121  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000222829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2036  hypothetical protein  35.22 
 
 		 939 aa  92.8  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0890  hypothetical protein  29 
 
 		 832 aa  61.2  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0004283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0036  hypothetical protein  24.37 
 
 		 982 aa  58.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0048  hypothetical protein  25.19 
 
 		 982 aa  58.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0033  hypothetical protein  24.62 
 
 		 982 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116472  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0034  hypothetical protein  24.64 
 
 		 975 aa  52  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.272533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.64 
 
 		 406 aa  46.2  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18539  predicted protein  25 
 
 		 713 aa  44.3  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118293  decreased coverage  0.000205789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>