117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7566 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7566  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  337  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  41.18 
 
 		 474 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  39 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  35.42 
 
 		 456 aa  68.2  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  42.17 
 
 		 448 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  34.38 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  32.35 
 
 		 493 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  34.95 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  36.46 
 
 		 446 aa  62.8  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  36.46 
 
 		 364 aa  62  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  33.68 
 
 		 925 aa  59.7  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  35.42 
 
 		 491 aa  59.7  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  36.47 
 
 		 460 aa  58.9  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  35.25 
 
 		 543 aa  57.8  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  33.91 
 
 		 681 aa  57.4  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.36 
 
 		 984 aa  57  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  34.38 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  42.11 
 
 		 978 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  31.76 
 
 		 847 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  31.31 
 
 		 366 aa  54.3  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  34.74 
 
 		 974 aa  53.9  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  34.38 
 
 		 688 aa  54.3  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  31 
 
 		 441 aa  53.9  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  34.74 
 
 		 743 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  30.23 
 
 		 400 aa  53.9  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  35.71 
 
 		 656 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  35.79 
 
 		 678 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  34.38 
 
 		 494 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  34.38 
 
 		 518 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  34.38 
 
 		 778 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  33.33 
 
 		 478 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  32.94 
 
 		 608 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  39.51 
 
 		 488 aa  52.8  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  39.66 
 
 		 359 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  36.96 
 
 		 593 aa  52  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  31.37 
 
 		 911 aa  51.2  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  41.07 
 
 		 372 aa  51.2  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  28.12 
 
 		 360 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  36.17 
 
 		 349 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  33.33 
 
 		 499 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  30.61 
 
 		 469 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  26.97 
 
 		 906 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  25.47 
 
 		 694 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3442  cellulose-binding family II  32.47 
 
 		 197 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.539727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  33.71 
 
 		 353 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  30 
 
 		 490 aa  48.9  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  34.67 
 
 		 436 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  29.9 
 
 		 466 aa  48.9  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  33.33 
 
 		 605 aa  48.5  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3539  cellulose-binding family II  36.36 
 
 		 444 aa  48.5  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0054545  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  39.06 
 
 		 774 aa  48.5  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  29.59 
 
 		 491 aa  48.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30 
 
 		 998 aa  48.1  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  33.33 
 
 		 429 aa  48.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  33.33 
 
 		 854 aa  48.1  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  29.9 
 
 		 763 aa  47.8  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  30.23 
 
 		 1055 aa  47.4  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  33.33 
 
 		 374 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  37.8 
 
 		 652 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  29.17 
 
 		 358 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  30.61 
 
 		 495 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  32.29 
 
 		 545 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  35.23 
 
 		 596 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  27.91 
 
 		 455 aa  45.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  29.17 
 
 		 913 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  34.07 
 
 		 679 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  28.57 
 
 		 460 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4285  cellulose-binding family II  30.77 
 
 		 472 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  31.33 
 
 		 623 aa  45.8  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  30.49 
 
 		 1137 aa  45.4  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 658 aa  45.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  28.74 
 
 		 580 aa  45.4  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  31.37 
 
 		 439 aa  45.4  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  30.68 
 
 		 393 aa  45.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  30.77 
 
 		 673 aa  45.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  30.85 
 
 		 875 aa  45.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  32.08 
 
 		 468 aa  45.1  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  28.16 
 
 		 486 aa  44.7  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  30.59 
 
 		 681 aa  44.7  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  29.17 
 
 		 403 aa  44.7  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  41.18 
 
 		 702 aa  44.7  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  27.45 
 
 		 449 aa  44.3  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  32.18 
 
 		 376 aa  44.3  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  31.33 
 
 		 842 aa  44.3  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  25.77 
 
 		 354 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  29.76 
 
 		 1209 aa  43.9  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  30.19 
 
 		 468 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  31.18 
 
 		 488 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  28.12 
 
 		 743 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  35.71 
 
 		 935 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  26.67 
 
 		 436 aa  43.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  30.49 
 
 		 1298 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 633 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  28.16 
 
 		 773 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  33.33 
 
 		 794 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  33.33 
 
 		 559 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  28.12 
 
 		 746 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  29.76 
 
 		 479 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  32.95 
 
 		 938 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  28.92 
 
 		 459 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>