16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3539 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3539  cellulose-binding family II  100 
 
 		 444 aa  844    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0054545  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3442  cellulose-binding family II  26.47 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.539727  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0644  cellulose-binding family II protein  29.39 
 
 		 291 aa  55.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  31.71 
 
 		 456 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  36.47 
 
 		 681 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  31.71 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  30.49 
 
 		 474 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7566  hypothetical protein  36.36 
 
 		 173 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  30 
 
 		 925 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.69 
 
 		 998 aa  45.8  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  27.83 
 
 		 543 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  28.4 
 
 		 447 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  29.07 
 
 		 436 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  30.38 
 
 		 347 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  30.51 
 
 		 468 aa  43.9  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  25.53 
 
 		 364 aa  43.5  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>