36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0644 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0644  cellulose-binding family II protein  100 
 
 		 291 aa  580  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0205  cellulose-binding family II  37.98 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  32.69 
 
 		 491 aa  59.7  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  31.07 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  31.43 
 
 		 559 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 628 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  37.5 
 
 		 442 aa  55.8  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  31.9 
 
 		 669 aa  53.1  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  34.34 
 
 		 925 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.71 
 
 		 998 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3539  cellulose-binding family II  29 
 
 		 444 aa  49.7  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0054545  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28 
 
 		 984 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3442  cellulose-binding family II  32.95 
 
 		 197 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.539727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  32.32 
 
 		 842 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  32.18 
 
 		 966 aa  47  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  29.36 
 
 		 875 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  30.97 
 
 		 942 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  32.58 
 
 		 580 aa  46.2  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  28.3 
 
 		 436 aa  45.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5296  hypothetical protein  25.74 
 
 		 385 aa  45.8  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  28.71 
 
 		 611 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  30.68 
 
 		 894 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  26.17 
 
 		 934 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  25.74 
 
 		 775 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  27.88 
 
 		 423 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  24.51 
 
 		 539 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  29 
 
 		 652 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  29.89 
 
 		 963 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  28.41 
 
 		 938 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  29.41 
 
 		 1007 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  30.34 
 
 		 507 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  24.24 
 
 		 455 aa  42.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  28.71 
 
 		 778 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  31.19 
 
 		 468 aa  42.7  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  30.68 
 
 		 851 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  27.78 
 
 		 514 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>