259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2410 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  86.36 
 
 		 462 aa  733    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 459 aa  948    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  57.18 
 
 		 466 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  66.78 
 
 		 426 aa  430  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  62.3 
 
 		 748 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  62.99 
 
 		 347 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  58.04 
 
 		 709 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  38.26 
 
 		 505 aa  220  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  38.51 
 
 		 505 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  32.14 
 
 		 930 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  33.23 
 
 		 755 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  32.9 
 
 		 322 aa  183  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  60.8 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  31.75 
 
 		 1302 aa  151  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  57.6 
 
 		 467 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  33.21 
 
 		 610 aa  151  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  33.21 
 
 		 451 aa  149  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  30.77 
 
 		 346 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  31.93 
 
 		 426 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  32.46 
 
 		 630 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  31.44 
 
 		 638 aa  137  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  50 
 
 		 613 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  33.81 
 
 		 1167 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  52.03 
 
 		 552 aa  117  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  30.8 
 
 		 457 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  30.96 
 
 		 717 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  55.91 
 
 		 542 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  43.69 
 
 		 514 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  44.25 
 
 		 507 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  43.69 
 
 		 539 aa  96.7  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  51.61 
 
 		 532 aa  96.7  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  42.59 
 
 		 540 aa  96.3  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  41.86 
 
 		 536 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  46 
 
 		 637 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  25.22 
 
 		 358 aa  89.7  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  29.48 
 
 		 626 aa  89.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  42.24 
 
 		 539 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  39.45 
 
 		 562 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  38.17 
 
 		 1007 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  23.19 
 
 		 651 aa  81.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12018  chitinase  41.22 
 
 		 142 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  37.07 
 
 		 652 aa  79.7  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  40.91 
 
 		 2310 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  37.76 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  40 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  36 
 
 		 997 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  24.76 
 
 		 1221 aa  74.3  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  38.1 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  41.05 
 
 		 487 aa  73.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  43.33 
 
 		 561 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  23.61 
 
 		 1194 aa  72  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  24.05 
 
 		 1004 aa  71.2  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  36.84 
 
 		 489 aa  71.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  37.93 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  31.17 
 
 		 762 aa  70.1  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  39.78 
 
 		 880 aa  70.1  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.81 
 
 		 998 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.2 
 
 		 984 aa  69.7  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  32.26 
 
 		 938 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  41.49 
 
 		 596 aa  68.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  33.01 
 
 		 925 aa  69.3  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  40.66 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  40.82 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  42.39 
 
 		 702 aa  68.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  40.22 
 
 		 727 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  33.98 
 
 		 559 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  38.71 
 
 		 580 aa  67.8  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  42.35 
 
 		 1209 aa  67.4  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  37.1 
 
 		 694 aa  67.4  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  34.4 
 
 		 619 aa  67  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  36.11 
 
 		 459 aa  67  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  36.17 
 
 		 846 aa  66.6  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  38.46 
 
 		 906 aa  66.6  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  37.89 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  23.53 
 
 		 378 aa  66.2  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  41.76 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  34.69 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  31.53 
 
 		 864 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  38.78 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  37.23 
 
 		 488 aa  65.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  34.69 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  40.78 
 
 		 894 aa  65.1  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  22.29 
 
 		 566 aa  65.1  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  33.33 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  34.38 
 
 		 2305 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  34.17 
 
 		 674 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  32.33 
 
 		 605 aa  63.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  36.45 
 
 		 934 aa  63.5  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  36.17 
 
 		 646 aa  63.2  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  35.09 
 
 		 1055 aa  62.4  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  33.88 
 
 		 674 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  33.04 
 
 		 679 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  34.31 
 
 		 911 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  41.18 
 
 		 763 aa  63.2  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  42.31 
 
 		 1298 aa  62.4  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  34.58 
 
 		 743 aa  63.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  39.77 
 
 		 674 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  38.64 
 
 		 674 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  38.64 
 
 		 674 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  32.8 
 
 		 854 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>