250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4682 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  100 
 
 		 593 aa  1179    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  37.05 
 
 		 682 aa  226  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  36.25 
 
 		 770 aa  209  8e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  36.73 
 
 		 454 aa  209  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4098  hypothetical protein  35.29 
 
 		 819 aa  188  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0136956  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  36.83 
 
 		 772 aa  184  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  32.46 
 
 		 570 aa  179  9e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  32.78 
 
 		 568 aa  179  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  32.99 
 
 		 541 aa  177  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  30.91 
 
 		 701 aa  171  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  31.77 
 
 		 1023 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  31.65 
 
 		 565 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  30.82 
 
 		 551 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  33.55 
 
 		 473 aa  159  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  33.04 
 
 		 843 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0236  hypothetical protein  31.31 
 
 		 498 aa  157  6e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2456  hypothetical protein  33.11 
 
 		 924 aa  157  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.35 
 
 		 1063 aa  143  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  30.22 
 
 		 999 aa  141  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  31.29 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1517  pectate lyase  30.88 
 
 		 450 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.188237  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  31.34 
 
 		 459 aa  124  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  30.43 
 
 		 537 aa  123  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  32.46 
 
 		 1031 aa  118  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  32.19 
 
 		 431 aa  118  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  31.54 
 
 		 425 aa  117  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2307  pectate lyase  30.2 
 
 		 425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284023 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0269  pectate lyase  31.44 
 
 		 421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.529079  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0351  pectate lyase  29.72 
 
 		 421 aa  108  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4785  hypothetical protein  30.03 
 
 		 467 aa  107  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.375184  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  51.46 
 
 		 673 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  51.06 
 
 		 460 aa  103  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  29.21 
 
 		 701 aa  103  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  54.17 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  55.43 
 
 		 349 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  54.08 
 
 		 448 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0937  ribosomal protein L24  30.16 
 
 		 427 aa  100  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761508 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  57.45 
 
 		 372 aa  99.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  52.48 
 
 		 449 aa  99.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  32.44 
 
 		 566 aa  97.8  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  50 
 
 		 847 aa  97.1  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3519  hypothetical protein  28.35 
 
 		 446 aa  96.7  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  31.84 
 
 		 1011 aa  95.9  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  50.94 
 
 		 702 aa  95.1  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  52.69 
 
 		 474 aa  94.7  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  28.3 
 
 		 670 aa  94.4  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  41.94 
 
 		 846 aa  94.7  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  57.89 
 
 		 474 aa  92.4  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  47.37 
 
 		 477 aa  91.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  53.41 
 
 		 456 aa  91.3  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  51.02 
 
 		 447 aa  91.7  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  55.67 
 
 		 658 aa  91.3  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  53.41 
 
 		 422 aa  90.1  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  51.76 
 
 		 354 aa  89.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  50.53 
 
 		 360 aa  88.6  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  43.43 
 
 		 495 aa  88.2  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  50.55 
 
 		 347 aa  87.4  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45 
 
 		 479 aa  87.8  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  34.03 
 
 		 710 aa  87.8  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  40.58 
 
 		 493 aa  86.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  42.86 
 
 		 437 aa  86.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  49.49 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  41.76 
 
 		 842 aa  84  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  44.68 
 
 		 678 aa  84  0.000000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  44.12 
 
 		 773 aa  84  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  42.39 
 
 		 459 aa  83.2  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  51.04 
 
 		 471 aa  83.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  42.39 
 
 		 485 aa  81.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  44.68 
 
 		 656 aa  82  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  47.31 
 
 		 453 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  47.19 
 
 		 913 aa  81.6  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  45.26 
 
 		 486 aa  80.9  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  46.39 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  46.85 
 
 		 978 aa  80.9  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  42.86 
 
 		 499 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  47.42 
 
 		 490 aa  79.3  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  36.51 
 
 		 812 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  46 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  43.88 
 
 		 763 aa  78.6  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  34.62 
 
 		 854 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0338  cellulose-binding family II  43.3 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247648  normal  0.0804617 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  40.66 
 
 		 743 aa  78.2  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  40.22 
 
 		 681 aa  77.8  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  45.16 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  47.67 
 
 		 1298 aa  77.4  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  37.62 
 
 		 488 aa  76.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  43.01 
 
 		 420 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  48.24 
 
 		 1137 aa  75.9  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  48.86 
 
 		 460 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  38.95 
 
 		 596 aa  75.1  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  51.58 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  32.46 
 
 		 609 aa  75.1  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  38.46 
 
 		 633 aa  75.1  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  43.4 
 
 		 468 aa  74.7  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  41.41 
 
 		 562 aa  74.3  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  43.88 
 
 		 1209 aa  74.3  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  43.48 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  37.76 
 
 		 746 aa  74.3  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  43.02 
 
 		 446 aa  73.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  53.66 
 
 		 649 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>