42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2456 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  56.48 
 
 		 843 aa  936    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4098  hypothetical protein  56.84 
 
 		 819 aa  915    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0136956  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2456  hypothetical protein  100 
 
 		 924 aa  1900    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  31.08 
 
 		 1023 aa  248  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  37.61 
 
 		 454 aa  228  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  38.13 
 
 		 770 aa  223  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  36.79 
 
 		 772 aa  220  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  32.93 
 
 		 551 aa  216  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  34.97 
 
 		 701 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  35.21 
 
 		 568 aa  212  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  33.8 
 
 		 570 aa  211  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  32.91 
 
 		 541 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  32.32 
 
 		 565 aa  197  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0236  hypothetical protein  34.76 
 
 		 498 aa  194  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  33.33 
 
 		 682 aa  193  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  33.47 
 
 		 473 aa  192  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  32.96 
 
 		 593 aa  170  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  29.28 
 
 		 999 aa  156  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  33.26 
 
 		 421 aa  145  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  31.88 
 
 		 537 aa  144  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1517  pectate lyase  31.33 
 
 		 450 aa  143  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.188237  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0269  pectate lyase  30.48 
 
 		 421 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.529079  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0351  pectate lyase  30.84 
 
 		 421 aa  129  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  32.51 
 
 		 425 aa  126  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  31.76 
 
 		 1031 aa  126  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4785  hypothetical protein  32.23 
 
 		 467 aa  125  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.375184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.6 
 
 		 1063 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  32.92 
 
 		 431 aa  121  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  35.25 
 
 		 459 aa  117  8.999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2307  pectate lyase  28.02 
 
 		 425 aa  108  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284023 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0937  ribosomal protein L24  27.54 
 
 		 427 aa  108  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761508 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3519  hypothetical protein  33.05 
 
 		 446 aa  103  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  27.35 
 
 		 701 aa  102  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  26.04 
 
 		 710 aa  90.5  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09367  conserved hypothetical protein  55.56 
 
 		 314 aa  87.4  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.477397  hitchhiker  0.00611411 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  27.2 
 
 		 670 aa  82.4  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1011 aa  82  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  33.12 
 
 		 566 aa  72  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09368  conserved hypothetical protein  29.63 
 
 		 185 aa  65.5  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.565145  hitchhiker  0.00269172 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  31.08 
 
 		 617 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3246  hypothetical protein  34.55 
 
 		 2760 aa  46.2  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  26 
 
 		 1160 aa  44.7  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>