41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4098 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4098  hypothetical protein  100 
 
 		 819 aa  1679    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0136956  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2456  hypothetical protein  56.84 
 
 		 924 aa  868    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  56.51 
 
 		 843 aa  896    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  36.65 
 
 		 1023 aa  254  5.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  38.67 
 
 		 772 aa  248  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  36.4 
 
 		 454 aa  244  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  36.55 
 
 		 770 aa  239  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  36.95 
 
 		 570 aa  229  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  36.04 
 
 		 682 aa  228  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  34.8 
 
 		 551 aa  224  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  35.71 
 
 		 701 aa  219  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  34.66 
 
 		 568 aa  218  5e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  34.51 
 
 		 541 aa  216  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0236  hypothetical protein  34.4 
 
 		 498 aa  206  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  33.27 
 
 		 565 aa  204  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  33.68 
 
 		 473 aa  191  7e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  34.88 
 
 		 593 aa  180  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  33.04 
 
 		 999 aa  162  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  32.29 
 
 		 421 aa  151  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  33.11 
 
 		 537 aa  145  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1517  pectate lyase  31.78 
 
 		 450 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.188237  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  30.44 
 
 		 431 aa  134  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  38.37 
 
 		 459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0269  pectate lyase  29.8 
 
 		 421 aa  132  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.529079  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0351  pectate lyase  29.08 
 
 		 421 aa  131  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  30.35 
 
 		 425 aa  128  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4785  hypothetical protein  29 
 
 		 467 aa  124  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.375184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.14 
 
 		 1063 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  32.18 
 
 		 1031 aa  120  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3519  hypothetical protein  27.54 
 
 		 446 aa  118  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0937  ribosomal protein L24  27.79 
 
 		 427 aa  110  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2307  pectate lyase  27.91 
 
 		 425 aa  109  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284023 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  27.68 
 
 		 701 aa  98.6  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  26.7 
 
 		 710 aa  98.6  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09367  conserved hypothetical protein  53.04 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.477397  hitchhiker  0.00611411 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  30.95 
 
 		 1011 aa  71.2  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  28.96 
 
 		 670 aa  66.6  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  31.91 
 
 		 566 aa  64.7  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09368  conserved hypothetical protein  29.31 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.565145  hitchhiker  0.00269172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  33.58 
 
 		 1394 aa  44.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  31.25 
 
 		 486 aa  44.7  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>