138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5913 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 
1063 aa  2105    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  56.9 
 
 
1949 aa  365  3e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  43.5 
 
 
1067 aa  218  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  41.4 
 
 
1056 aa  210  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1009  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.95 
 
 
802 aa  200  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4744  putative outer membrane adhesin like protein  43.46 
 
 
666 aa  179  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511214  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  33.83 
 
 
3927 aa  168  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0847  putative outer membrane adhesin like protein  36.53 
 
 
567 aa  162  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189392  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  31.03 
 
 
772 aa  161  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  29.09 
 
 
770 aa  148  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  31.28 
 
 
682 aa  147  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  33.25 
 
 
2377 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  27.69 
 
 
1597 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.76 
 
 
1884 aa  139  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  35.89 
 
 
1867 aa  131  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  31.42 
 
 
593 aa  131  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  28.04 
 
 
541 aa  128  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  29.08 
 
 
473 aa  127  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  28.78 
 
 
454 aa  127  9e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1718  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.66 
 
 
777 aa  125  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4098  hypothetical protein  27.38 
 
 
819 aa  122  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0136956  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  30.49 
 
 
421 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  28.83 
 
 
1023 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  26.45 
 
 
701 aa  117  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  26.91 
 
 
565 aa  117  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.9 
 
 
2507 aa  115  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5004  hypothetical protein  43.19 
 
 
1039 aa  114  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  26.64 
 
 
570 aa  114  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  26.85 
 
 
551 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4736  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.25 
 
 
1433 aa  112  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159607 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  29.76 
 
 
537 aa  112  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  28.69 
 
 
999 aa  108  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  26.8 
 
 
568 aa  107  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1517  pectate lyase  28.06 
 
 
450 aa  104  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.188237  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0236  hypothetical protein  28.66 
 
 
498 aa  103  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1597  hypothetical protein  34.06 
 
 
898 aa  102  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.489596 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  29.07 
 
 
843 aa  101  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2456  hypothetical protein  27.93 
 
 
924 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  33.67 
 
 
892 aa  100  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  30.29 
 
 
5745 aa  98.2  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  28.46 
 
 
1031 aa  94.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  30.65 
 
 
4978 aa  91.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  27.6 
 
 
4798 aa  89  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  31.68 
 
 
1416 aa  87.4  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  30.13 
 
 
1512 aa  85.9  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4785  hypothetical protein  30.6 
 
 
467 aa  85.5  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.375184  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  34.74 
 
 
459 aa  84.7  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3803  hypothetical protein  29.53 
 
 
1181 aa  84.7  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.69 
 
 
994 aa  83.2  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.64 
 
 
761 aa  82  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0269  pectate lyase  33.07 
 
 
421 aa  79.3  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.529079  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  30.15 
 
 
431 aa  79  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  29 
 
 
8321 aa  78.6  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  29.85 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.14 
 
 
850 aa  78.6  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  27.79 
 
 
3191 aa  78.2  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2307  pectate lyase  26.89 
 
 
425 aa  75.5  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00284023 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0351  pectate lyase  32.27 
 
 
421 aa  75.9  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2591  hypothetical protein  27.21 
 
 
1188 aa  75.1  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225113  normal  0.278205 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.94 
 
 
2114 aa  74.7  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  33.71 
 
 
2816 aa  74.7  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0780  hypothetical protein  32.46 
 
 
909 aa  73.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  28.12 
 
 
5020 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0937  ribosomal protein L24  35.33 
 
 
427 aa  68.6  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00761508 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  31.66 
 
 
1011 aa  67.8  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  28.09 
 
 
2454 aa  67.4  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  29.03 
 
 
1779 aa  67  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.28 
 
 
3816 aa  67  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  23.43 
 
 
2074 aa  66.6  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  32.16 
 
 
701 aa  65.1  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  28.13 
 
 
721 aa  63.9  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.3 
 
 
1553 aa  64.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  30.27 
 
 
670 aa  64.3  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  32.58 
 
 
566 aa  63.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  27.65 
 
 
2784 aa  62.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  26.99 
 
 
3439 aa  62.4  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  27.69 
 
 
2153 aa  62.4  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.94 
 
 
2807 aa  61.6  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  30.68 
 
 
710 aa  60.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  27.35 
 
 
1215 aa  60.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  26.84 
 
 
4848 aa  60.1  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  27.24 
 
 
1215 aa  59.7  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  27.24 
 
 
1215 aa  59.7  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  32.32 
 
 
1712 aa  58.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  26.57 
 
 
5094 aa  57.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  25.22 
 
 
1706 aa  57  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  22.63 
 
 
369 aa  57  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  25.18 
 
 
16311 aa  56.6  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.76 
 
 
3363 aa  56.2  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.55 
 
 
1215 aa  56.2  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  26.55 
 
 
1215 aa  56.2  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2224  hypothetical protein  56.82 
 
 
998 aa  55.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.134781 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  24.39 
 
 
3182 aa  55.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  26.22 
 
 
2839 aa  55.5  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3519  hypothetical protein  32.19 
 
 
446 aa  55.5  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  28.5 
 
 
2555 aa  55.1  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  34.06 
 
 
715 aa  54.7  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0859  hypothetical protein  63.41 
 
 
945 aa  54.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0876  hypothetical protein  63.41 
 
 
945 aa  54.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0865  hypothetical protein  63.41 
 
 
945 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>