120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2397 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  100 
 
 		 670 aa  1326    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  71.9 
 
 		 1011 aa  585  1.0000000000000001e-165  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  62.93 
 
 		 566 aa  488  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  48.17 
 
 		 710 aa  332  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  48.23 
 
 		 701 aa  330  6e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4785  hypothetical protein  42.51 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.375184  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  32.56 
 
 		 425 aa  176  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0269  pectate lyase  32.36 
 
 		 421 aa  172  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.529079  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  31.44 
 
 		 431 aa  171  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0351  pectate lyase  31.41 
 
 		 421 aa  169  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  31.04 
 
 		 1031 aa  137  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0937  ribosomal protein L24  30.36 
 
 		 427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761508 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1517  pectate lyase  30.61 
 
 		 450 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.188237  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2307  pectate lyase  30.03 
 
 		 425 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00284023 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  29.65 
 
 		 682 aa  115  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3519  hypothetical protein  29.58 
 
 		 446 aa  114  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2390  Carbohydrate-binding family V/XII  56.12 
 
 		 523 aa  110  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.254143  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2393  PKD domain containing protein  57.73 
 
 		 600 aa  107  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.562625  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  30.82 
 
 		 454 aa  106  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3040  pectate lyase  30.85 
 
 		 459 aa  104  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00328566  normal  0.615861 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  33.94 
 
 		 772 aa  94.7  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  28.3 
 
 		 593 aa  94.4  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0236  hypothetical protein  32.4 
 
 		 498 aa  90.9  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  55.42 
 
 		 831 aa  88.6  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  48.39 
 
 		 768 aa  87.4  7e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  35.12 
 
 		 770 aa  86.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2788  hypothetical protein  25.74 
 
 		 541 aa  84.7  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4572  hypothetical protein  27.09 
 
 		 537 aa  84  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4093  hypothetical protein  28.63 
 
 		 570 aa  83.2  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00468753  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2795  hypothetical protein  29.34 
 
 		 551 aa  82  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  46.43 
 
 		 524 aa  80.9  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  31.47 
 
 		 421 aa  80.5  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2456  hypothetical protein  27.04 
 
 		 924 aa  80.1  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2151  hypothetical protein  31.28 
 
 		 565 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00303594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  31.05 
 
 		 1023 aa  76.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  24.3 
 
 		 999 aa  74.7  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4091  hypothetical protein  27.84 
 
 		 568 aa  74.3  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2792  hypothetical protein  29.22 
 
 		 843 aa  73.9  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.66343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1802  hypothetical protein  29.38 
 
 		 701 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0034444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.63 
 
 		 1063 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4098  hypothetical protein  28.96 
 
 		 819 aa  65.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0136956  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  50.67 
 
 		 639 aa  63.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0948  hypothetical protein  25.48 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.289629  hitchhiker  0.0000199751 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  36.97 
 
 		 1002 aa  61.2  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  36.97 
 
 		 1247 aa  61.2  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  36.97 
 
 		 1474 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.33 
 
 		 639 aa  57.8  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  49.25 
 
 		 623 aa  57.4  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  35.29 
 
 		 1217 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  35.29 
 
 		 1585 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  43.04 
 
 		 1057 aa  56.2  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  38.54 
 
 		 816 aa  53.9  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  43.48 
 
 		 884 aa  53.5  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0135  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  48.44 
 
 		 386 aa  53.5  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.73051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1255  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  38.16 
 
 		 601 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  36.13 
 
 		 861 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  47.46 
 
 		 2066 aa  52.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  36.89 
 
 		 940 aa  52  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  29.55 
 
 		 780 aa  50.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  40.58 
 
 		 712 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  41.1 
 
 		 677 aa  49.7  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  38.67 
 
 		 967 aa  48.9  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  50.82 
 
 		 930 aa  48.9  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.62 
 
 		 947 aa  48.5  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  47.46 
 
 		 944 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  47.46 
 
 		 944 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  47.46 
 
 		 1150 aa  48.5  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.86 
 
 		 6885 aa  48.1  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  45 
 
 		 944 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  47.46 
 
 		 944 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  45.76 
 
 		 1916 aa  48.1  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  33.33 
 
 		 965 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  33.33 
 
 		 965 aa  47.8  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  33.33 
 
 		 965 aa  47.8  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  57.69 
 
 		 1732 aa  47.8  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  47.46 
 
 		 1565 aa  47.4  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  48.21 
 
 		 528 aa  47.4  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  42.59 
 
 		 1814 aa  47  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  50.98 
 
 		 873 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  29.21 
 
 		 1266 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  47.92 
 
 		 938 aa  47  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  34.67 
 
 		 965 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  49.23 
 
 		 848 aa  47  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  31.18 
 
 		 960 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  35.05 
 
 		 735 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  50 
 
 		 1094 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  31.18 
 
 		 960 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1399  PKD domain containing protein  40.38 
 
 		 669 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  34.78 
 
 		 965 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  33.33 
 
 		 965 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  48.08 
 
 		 852 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  55.77 
 
 		 3295 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  33.33 
 
 		 965 aa  45.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  52.63 
 
 		 943 aa  45.8  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  46.67 
 
 		 778 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  43.1 
 
 		 918 aa  45.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  46.67 
 
 		 778 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  33.33 
 
 		 965 aa  45.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  46.67 
 
 		 778 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  37.88 
 
 		 792 aa  45.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>