65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2510 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  100 
 
 		 626 aa  1242    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  40.31 
 
 		 1004 aa  290  4e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  34.02 
 
 		 651 aa  232  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  32.86 
 
 		 1221 aa  229  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  29.84 
 
 		 703 aa  192  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  26.87 
 
 		 768 aa  192  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  33.02 
 
 		 717 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0302  glycoside hydrolase family 5  30.95 
 
 		 481 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0480106  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  29.28 
 
 		 358 aa  117  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  24.25 
 
 		 755 aa  95.5  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  29.44 
 
 		 466 aa  92.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  24.24 
 
 		 930 aa  92.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  30.73 
 
 		 1418 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  25.25 
 
 		 347 aa  87  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  24.68 
 
 		 709 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 		 462 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  32.49 
 
 		 1474 aa  84.3  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  32.49 
 
 		 1247 aa  84.3  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  32.49 
 
 		 1217 aa  84  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  32.49 
 
 		 1002 aa  84  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  32.49 
 
 		 1585 aa  83.6  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  29.64 
 
 		 459 aa  83.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  26.44 
 
 		 365 aa  82.8  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  24.44 
 
 		 748 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  31.28 
 
 		 1275 aa  81.3  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  26.54 
 
 		 1302 aa  80.9  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  26.33 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  23.6 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  27.78 
 
 		 1223 aa  76.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  26.49 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1167 aa  75.1  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  24.4 
 
 		 505 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  24.8 
 
 		 505 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  22.97 
 
 		 566 aa  70.9  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  24.85 
 
 		 426 aa  70.1  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3463  Carbohydrate-binding family 9  28.26 
 
 		 691 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0207696  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  26.22 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  22.93 
 
 		 322 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  22.82 
 
 		 1020 aa  64.7  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  24.09 
 
 		 638 aa  63.9  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  25.13 
 
 		 630 aa  64.3  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  30.86 
 
 		 1160 aa  63.9  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  22.33 
 
 		 1059 aa  62  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  28.71 
 
 		 1748 aa  62.4  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  22.33 
 
 		 1059 aa  62  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  26.25 
 
 		 610 aa  58.2  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0643  Carbohydrate-binding family 9  26.47 
 
 		 215 aa  53.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  27.61 
 
 		 340 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0723  glycoside hydrolase family protein  24.58 
 
 		 362 aa  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  24.08 
 
 		 1041 aa  50.4  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.9 
 
 		 998 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2393  PKD domain containing protein  27.19 
 
 		 600 aa  48.5  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.562625  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  21.85 
 
 		 1194 aa  48.1  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  24.19 
 
 		 1050 aa  47.8  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  25.11 
 
 		 332 aa  47.4  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  30.48 
 
 		 948 aa  47.8  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  25.36 
 
 		 525 aa  47.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  23.97 
 
 		 359 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  19.4 
 
 		 584 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  23.22 
 
 		 312 aa  45.4  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  36.17 
 
 		 1887 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  34.09 
 
 		 647 aa  45.8  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  24.62 
 
 		 1242 aa  45.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  25.81 
 
 		 2286 aa  44.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  25.52 
 
 		 705 aa  44.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>