40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2103 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  100 
 
 		 346 aa  721    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  47.37 
 
 		 1302 aa  301  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  50.48 
 
 		 638 aa  296  4e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  50 
 
 		 630 aa  292  6e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  53.24 
 
 		 610 aa  285  7e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  44.51 
 
 		 505 aa  278  8e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  44.75 
 
 		 505 aa  278  9e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  48.9 
 
 		 426 aa  271  9e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  49.67 
 
 		 451 aa  270  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  43.44 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  43.84 
 
 		 457 aa  249  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  43.62 
 
 		 1167 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  36.6 
 
 		 930 aa  194  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  34.92 
 
 		 755 aa  192  8e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  34.64 
 
 		 466 aa  186  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  37.05 
 
 		 709 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  33.44 
 
 		 347 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  33.02 
 
 		 748 aa  172  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  33.55 
 
 		 426 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  31.94 
 
 		 462 aa  149  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  30.62 
 
 		 459 aa  143  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  32.33 
 
 		 717 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  28.84 
 
 		 1221 aa  86.7  6e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  30.73 
 
 		 703 aa  79.3  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  23.6 
 
 		 626 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  27.16 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  25.24 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0302  glycoside hydrolase family 5  30.87 
 
 		 481 aa  70.1  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0480106  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  23.99 
 
 		 651 aa  62.8  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  21.57 
 
 		 1004 aa  61.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  28.91 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  32.03 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  24.88 
 
 		 768 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  21.75 
 
 		 1194 aa  54.3  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  24.66 
 
 		 566 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  25.68 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  22.26 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  24.41 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  26.92 
 
 		 635 aa  43.1  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  23.74 
 
 		 468 aa  42.7  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>