38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0302 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0302  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 481 aa  975    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0480106  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  45.43 
 
 		 1221 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  43.14 
 
 		 703 aa  329  6e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  35.45 
 
 		 651 aa  219  7e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  31.16 
 
 		 768 aa  193  6e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  31.48 
 
 		 1004 aa  153  8e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  30.95 
 
 		 626 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  28 
 
 		 717 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  27.14 
 
 		 451 aa  87.8  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  26.97 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  31.46 
 
 		 1167 aa  83.6  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  25.07 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  30 
 
 		 610 aa  78.6  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  24.78 
 
 		 755 aa  72.8  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  31.35 
 
 		 638 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  23.5 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0988  glycoside hydrolase family 10  66 
 
 		 975 aa  71.6  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.661558  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  30.87 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  29.15 
 
 		 630 aa  69.7  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  25.42 
 
 		 1302 aa  67  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  23.14 
 
 		 566 aa  66.6  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  23.81 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  25.95 
 
 		 930 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  25.45 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  31.21 
 
 		 505 aa  56.6  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  26.04 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  22.96 
 
 		 468 aa  55.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  22.77 
 
 		 347 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  26.29 
 
 		 505 aa  52.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  27.36 
 
 		 1194 aa  51.2  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  22.08 
 
 		 748 aa  50.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  25.75 
 
 		 709 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  24.69 
 
 		 322 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  66 
 
 		 699 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  38.24 
 
 		 887 aa  47.4  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  23.47 
 
 		 466 aa  47  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  25 
 
 		 426 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  26.67 
 
 		 525 aa  43.5  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>