61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2256 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  97.19 
 
 		 356 aa  674    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  100 
 
 		 356 aa  736    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  56.75 
 
 		 347 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  52.08 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  53.12 
 
 		 376 aa  367  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  47.48 
 
 		 420 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  41.27 
 
 		 349 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  42.12 
 
 		 363 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  39.08 
 
 		 349 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  39.94 
 
 		 635 aa  247  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  39.61 
 
 		 336 aa  239  6.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1066  cellulase  40 
 
 		 709 aa  230  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  36.77 
 
 		 340 aa  209  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05214  Endo-beta-1,4-glucanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS8]  35.94 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  39.39 
 
 		 556 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01285  Endo-beta-1,4-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDU5]  34.29 
 
 		 326 aa  189  5e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2344  glycoside hydrolase family protein  27.01 
 
 		 352 aa  155  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1155  glycoside hydrolase family 5  31.82 
 
 		 749 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.675797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4460  glycoside hydrolase family protein  24.74 
 
 		 814 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3417  twin-arginine translocation pathway signal  23.62 
 
 		 831 aa  72.8  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  28.03 
 
 		 869 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2924  glycoside hydrolase family protein  21.16 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0736  glycoside hydrolase family 5  26.32 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  hitchhiker  0.000337788 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  25.75 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  22.34 
 
 		 814 aa  60.1  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  22.96 
 
 		 468 aa  56.6  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  30.47 
 
 		 717 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  26.42 
 
 		 332 aa  55.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0079  glycoside hydrolase family 5  25.37 
 
 		 391 aa  54.3  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.265461  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  27.63 
 
 		 545 aa  53.5  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  24.36 
 
 		 312 aa  52.8  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  21.15 
 
 		 365 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  25.48 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  24.43 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  24.04 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  28.06 
 
 		 542 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  26.7 
 
 		 468 aa  50.4  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  25.13 
 
 		 523 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  25.88 
 
 		 1194 aa  50.1  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  27.4 
 
 		 337 aa  49.7  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0078  hypothetical protein  24.76 
 
 		 421 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656506  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  23.58 
 
 		 525 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  29.82 
 
 		 1115 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  29.23 
 
 		 497 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  22.65 
 
 		 561 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  23.56 
 
 		 533 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1099  glycoside hydrolase family 5  24.26 
 
 		 475 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  27.12 
 
 		 445 aa  47  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  22.27 
 
 		 1004 aa  46.6  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  21.16 
 
 		 370 aa  46.2  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2228  glycoside hydrolase family 5  25.84 
 
 		 403 aa  45.4  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  25.87 
 
 		 847 aa  45.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  24.2 
 
 		 705 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1713  glycoside hydrolase family protein  23.58 
 
 		 472 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0325  dihydroxy-acid dehydratase  25 
 
 		 451 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.375618  normal  0.486344 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  24.81 
 
 		 900 aa  43.1  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  25.93 
 
 		 572 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  24.29 
 
 		 426 aa  42.7  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  23.56 
 
 		 453 aa  42.7  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  24.61 
 
 		 539 aa  42.7  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  28.78 
 
 		 563 aa  42.7  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>