17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0078 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0078  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  878    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656506  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0079  glycoside hydrolase family 5  45.08 
 
 		 391 aa  349  4e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.265461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  40.33 
 
 		 400 aa  299  6e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0736  glycoside hydrolase family 5  28.54 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  hitchhiker  0.000337788 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  29 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  26.16 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  22.59 
 
 		 347 aa  53.5  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  29.77 
 
 		 673 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 556 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1682  glycosy hydrolase family protein  25.1 
 
 		 434 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4037  glycoside hydrolase family protein  27.04 
 
 		 393 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  31.58 
 
 		 601 aa  47.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  25.2 
 
 		 356 aa  45.1  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  21.51 
 
 		 349 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  25.41 
 
 		 363 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3417  twin-arginine translocation pathway signal  27.51 
 
 		 831 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  23.61 
 
 		 349 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>