29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0736 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0736  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 
399 aa  798    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  hitchhiker  0.000337788 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0079  glycoside hydrolase family 5  35.22 
 
 
391 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.265461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  33.42 
 
 
400 aa  167  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0078  hypothetical protein  28.78 
 
 
421 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  29.26 
 
 
556 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  28.39 
 
 
333 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  28.67 
 
 
347 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  26.97 
 
 
356 aa  60.5  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  26.32 
 
 
356 aa  57.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2344  glycoside hydrolase family protein  24.2 
 
 
352 aa  57.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  29.65 
 
 
635 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.342079 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01285  Endo-beta-1,4-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDU5]  31.22 
 
 
326 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  25.55 
 
 
363 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  25 
 
 
420 aa  54.7  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  31.43 
 
 
340 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  23.86 
 
 
349 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  32.67 
 
 
376 aa  53.1  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  27.42 
 
 
336 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  27.63 
 
 
349 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1066  cellulase  29.31 
 
 
709 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.756742 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1155  glycoside hydrolase family 5  27.91 
 
 
749 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.675797  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4460  glycoside hydrolase family protein  24.23 
 
 
814 aa  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 
562 aa  49.3  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  21.84 
 
 
673 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  25.78 
 
 
525 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  31.33 
 
 
601 aa  44.3  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  23.27 
 
 
660 aa  43.9  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  20.3 
 
 
539 aa  43.5  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  23.93 
 
 
545 aa  42.7  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>