46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0779 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0779  Cellulase  100 
 
 		 336 aa  689    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  42.36 
 
 		 347 aa  262  8e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  43.25 
 
 		 333 aa  258  8e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  42.12 
 
 		 376 aa  252  5.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  42.09 
 
 		 635 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  42.21 
 
 		 420 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  39.61 
 
 		 356 aa  236  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  38.94 
 
 		 356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4499  Cellulase  40.71 
 
 		 349 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.591469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1066  cellulase  42.02 
 
 		 709 aa  228  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756742 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  40.66 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  35.42 
 
 		 363 aa  200  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1077  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 		 340 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.257076  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  38.46 
 
 		 556 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05214  Endo-beta-1,4-glucanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS8]  35.37 
 
 		 334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.712595 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01285  Endo-beta-1,4-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BDU5]  35.99 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2344  glycoside hydrolase family protein  32.92 
 
 		 352 aa  166  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1155  glycoside hydrolase family 5  27.05 
 
 		 749 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.675797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4460  glycoside hydrolase family protein  29.93 
 
 		 814 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3417  twin-arginine translocation pathway signal  27.71 
 
 		 831 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2924  glycoside hydrolase family protein  28.7 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4600  glycoside hydrolase family protein  23.1 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  20.78 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0079  glycoside hydrolase family 5  24.22 
 
 		 391 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.265461  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  18.67 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  25.99 
 
 		 814 aa  54.3  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0736  glycoside hydrolase family 5  27.42 
 
 		 399 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  hitchhiker  0.000337788 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  28.23 
 
 		 365 aa  49.7  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0723  glycoside hydrolase family protein  25.17 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4876  Cellulase  27.91 
 
 		 572 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  24.5 
 
 		 525 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  20.48 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3335  Cellulase  29.13 
 
 		 578 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  27.82 
 
 		 681 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  21.94 
 
 		 335 aa  47  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  29.66 
 
 		 717 aa  46.2  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  31 
 
 		 593 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  23.67 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  28.36 
 
 		 523 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  20.8 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  24.9 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  23.73 
 
 		 755 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1586  Cellulase  23.08 
 
 		 545 aa  43.5  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  22.04 
 
 		 370 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3202  cellulase  31.15 
 
 		 743 aa  42.7  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000270074  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  26.71 
 
 		 1194 aa  42.7  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>