65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4161 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5261  glycoside hydrolase family 1  74.89 
 
 		 453 aa  693    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4161  glycoside hydrolase family 1  100 
 
 		 451 aa  923    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2019  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  54.14 
 
 		 738 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2008  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  53.5 
 
 		 723 aa  454  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4020  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  49.64 
 
 		 730 aa  428  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4111  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  49.16 
 
 		 730 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3623  glycoside hydrolase family protein  31.41 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.635142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20600  glycoside hydrolase family 1  27.81 
 
 		 424 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5470  glycoside hydrolase family 1  25.61 
 
 		 446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03060  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  27.71 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3624  hypothetical protein  26.14 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.183604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  21.73 
 
 		 452 aa  72.4  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2701  hypothetical protein  25.2 
 
 		 380 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0359673 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 		 765 aa  67.8  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0222  amine oxidase  26.4 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0751337  normal  0.686886 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2342  hypothetical protein  25.3 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3481  glycoside hydrolase family 1  23.29 
 
 		 470 aa  63.9  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  23.62 
 
 		 1293 aa  63.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1304  beta-glucosidase/6-phospho-beta-glucosidase/ beta -galactosidase  24.15 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1193  hypothetical protein  25.67 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.735987 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2739  glycoside hydrolase family protein  22.16 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0743  Beta-glucosidase  24.43 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  23.74 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2841  glycoside hydrolase family protein  23.27 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  22.48 
 
 		 478 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0979  Beta-glucosidase  24.17 
 
 		 475 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  23.22 
 
 		 472 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1456  glycoside hydrolase family 1  28.73 
 
 		 430 aa  53.5  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  23.58 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  21.16 
 
 		 465 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  26.62 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  20.35 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  26.9 
 
 		 439 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  25.59 
 
 		 460 aa  50.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2897  hypothetical protein  26.23 
 
 		 380 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.559953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0345  6-phospho-beta-glucosidase  20.72 
 
 		 455 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 		 763 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  24.71 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  28.95 
 
 		 463 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5713  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.46 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal  0.0238528 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  28.57 
 
 		 468 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  28.74 
 
 		 457 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  21.05 
 
 		 478 aa  47.8  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  24.58 
 
 		 431 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0791  6-phospho-beta-glucosidase  20.63 
 
 		 475 aa  47  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.240964  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  26.57 
 
 		 468 aa  47  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  21.35 
 
 		 438 aa  47  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  23.22 
 
 		 470 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3965  glycoside hydrolase family protein  26.04 
 
 		 487 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0878  glycoside hydrolase family 6-phospho-beta-glucosidase  24.32 
 
 		 479 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0383438  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0267  Beta-glucosidase  21.76 
 
 		 464 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  24.87 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  23.06 
 
 		 479 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  26.12 
 
 		 467 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  25 
 
 		 457 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4095  glycoside hydrolase family 1  20.57 
 
 		 469 aa  45.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.362343  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2987  6-phospho-beta-glucosidase  25.42 
 
 		 476 aa  44.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0783146 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  23.42 
 
 		 463 aa  44.3  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  23.24 
 
 		 458 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3901  glycoside hydrolase family 1  24.18 
 
 		 479 aa  43.9  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00796853  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  22.22 
 
 		 470 aa  43.5  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0860  beta-glucosidase  22.52 
 
 		 479 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0682  glycoside hydrolase family 1  23.78 
 
 		 461 aa  43.5  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1668  glycoside hydrolase family 1  26.13 
 
 		 465 aa  43.1  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.373408  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  19.95 
 
 		 439 aa  43.1  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>