38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1304 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1304  beta-glucosidase/6-phospho-beta-glucosidase/ beta -galactosidase  100 
 
 		 381 aa  767    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2701  hypothetical protein  52.89 
 
 		 380 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0359673 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  52.17 
 
 		 763 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  51.82 
 
 		 765 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2342  hypothetical protein  50.27 
 
 		 380 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1193  hypothetical protein  52.72 
 
 		 397 aa  360  3e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.735987 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2897  hypothetical protein  49.6 
 
 		 380 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.559953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0086  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  53.7 
 
 		 392 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3624  hypothetical protein  40.59 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.183604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0222  amine oxidase  39.23 
 
 		 402 aa  242  9e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0751337  normal  0.686886 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  39.24 
 
 		 1293 aa  237  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20600  glycoside hydrolase family 1  27.01 
 
 		 424 aa  92.8  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5470  glycoside hydrolase family 1  27.04 
 
 		 446 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3623  glycoside hydrolase family protein  25.21 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.635142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  20.1 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4161  glycoside hydrolase family 1  25.36 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5261  glycoside hydrolase family 1  24.39 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2008  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.12 
 
 		 723 aa  56.6  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  20.47 
 
 		 418 aa  56.2  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3481  glycoside hydrolase family 1  22.59 
 
 		 470 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03060  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  24.63 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2019  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.8 
 
 		 738 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240233  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl313  beta-glucosidase/alpha xylosidase  20.84 
 
 		 469 aa  52.8  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000597092  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  26.23 
 
 		 436 aa  49.7  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4111  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.5 
 
 		 730 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  23.12 
 
 		 443 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  23.48 
 
 		 431 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  24.03 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4020  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.66 
 
 		 730 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  21.79 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1558  glycoside hydrolase family protein  26.74 
 
 		 467 aa  44.3  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000340299  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0345  6-phospho-beta-glucosidase  21.56 
 
 		 455 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  21.84 
 
 		 446 aa  43.9  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  24.39 
 
 		 446 aa  43.5  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  20.51 
 
 		 474 aa  43.5  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  26.56 
 
 		 442 aa  43.1  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  29.82 
 
 		 934 aa  43.1  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  30.67 
 
 		 458 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>