24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1193 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1193  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  818    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.735987 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2701  hypothetical protein  61.73 
 
 
380 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0359673 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2342  hypothetical protein  61.89 
 
 
380 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2897  hypothetical protein  62.75 
 
 
380 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.559953  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  55.31 
 
 
765 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  55.07 
 
 
763 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0086  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  55.09 
 
 
392 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1304  beta-glucosidase/6-phospho-beta-glucosidase/ beta -galactosidase  52.72 
 
 
381 aa  361  1e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0222  amine oxidase  40.27 
 
 
402 aa  263  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0751337  normal  0.686886 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3624  hypothetical protein  41.49 
 
 
383 aa  257  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.183604  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  37.92 
 
 
1293 aa  246  4e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20600  glycoside hydrolase family 1  26.63 
 
 
424 aa  94  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5470  glycoside hydrolase family 1  24.2 
 
 
446 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3623  glycoside hydrolase family protein  27.14 
 
 
431 aa  80.1  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.635142  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2008  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.99 
 
 
723 aa  74.7  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4161  glycoside hydrolase family 1  30.67 
 
 
451 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167873  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  21.17 
 
 
418 aa  56.6  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4111  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.13 
 
 
730 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2019  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.43 
 
 
738 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240233  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03060  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  24.35 
 
 
433 aa  50.4  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4020  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.79 
 
 
730 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  21.78 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  19.84 
 
 
427 aa  44.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  23.02 
 
 
470 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>