52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2701 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2701  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  783    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0359673 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2897  hypothetical protein  82.23 
 
 		 380 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.559953  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2342  hypothetical protein  60.6 
 
 		 380 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1193  hypothetical protein  61.73 
 
 		 397 aa  450  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.735987 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1304  beta-glucosidase/6-phospho-beta-glucosidase/ beta -galactosidase  52.89 
 
 		 381 aa  372  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  51.34 
 
 		 763 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  49.87 
 
 		 765 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0086  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  53.48 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  39.3 
 
 		 1293 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0222  amine oxidase  37.84 
 
 		 402 aa  239  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0751337  normal  0.686886 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3624  hypothetical protein  39.34 
 
 		 383 aa  237  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.183604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20600  glycoside hydrolase family 1  23.84 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5470  glycoside hydrolase family 1  28.05 
 
 		 446 aa  97.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3623  glycoside hydrolase family protein  28.02 
 
 		 431 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.635142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03060  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  26.93 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5261  glycoside hydrolase family 1  24.39 
 
 		 453 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4161  glycoside hydrolase family 1  29.78 
 
 		 451 aa  70.1  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2008  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.98 
 
 		 723 aa  70.1  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  25.84 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  24.53 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  22.09 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2019  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.04 
 
 		 738 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  23.38 
 
 		 446 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  21.8 
 
 		 451 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  22.22 
 
 		 451 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  21.53 
 
 		 451 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  21.35 
 
 		 443 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  21.53 
 
 		 451 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  21.45 
 
 		 443 aa  54.3  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  24.8 
 
 		 452 aa  54.3  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4111  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.98 
 
 		 730 aa  53.1  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  20.99 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  23.46 
 
 		 443 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0727  glycoside hydrolase family protein  21.74 
 
 		 357 aa  50.4  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0741  glycoside hydrolase family protein  22.29 
 
 		 358 aa  50.1  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.595255 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0878  glycoside hydrolase family 6-phospho-beta-glucosidase  19.55 
 
 		 479 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0383438  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0860  beta-glucosidase  19.55 
 
 		 479 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  20.9 
 
 		 474 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0785  glycoside hydrolase family protein  19.83 
 
 		 479 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  22.59 
 
 		 447 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1708  glycoside hydrolase family protein  21.25 
 
 		 356 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.913199  normal  0.0276874 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  19.43 
 
 		 442 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  22.71 
 
 		 463 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2438  glycoside hydrolase family 1  21.29 
 
 		 468 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0255622  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0340  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  23.72 
 
 		 481 aa  45.8  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  22.05 
 
 		 449 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1165  6-phospho-beta-glucosidase  21.85 
 
 		 478 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4005  glycoside hydrolase family protein  22.39 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2841  glycoside hydrolase family protein  23.42 
 
 		 467 aa  44.3  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0224  6-phospho-beta-glucosidase  22.42 
 
 		 480 aa  43.9  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  22.66 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3160  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  24.16 
 
 		 474 aa  43.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>