More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1708 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1708  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 356 aa  738    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.913199  normal  0.0276874 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0727  glycoside hydrolase family protein  72.88 
 
 		 357 aa  580  1e-164  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0741  glycoside hydrolase family protein  67.61 
 
 		 358 aa  549  1e-155  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.595255 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0630  glycoside hydrolase family protein  64.12 
 
 		 364 aa  501  1e-141  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  30 
 
 		 418 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  26.94 
 
 		 399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  26.41 
 
 		 431 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  27.51 
 
 		 431 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  26.98 
 
 		 417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  26.97 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4005  glycoside hydrolase family protein  27.54 
 
 		 437 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  25.71 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  25.8 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  26.96 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  23.61 
 
 		 443 aa  99  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  23.57 
 
 		 470 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  23.06 
 
 		 443 aa  97.4  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 443 aa  97.1  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  23.54 
 
 		 449 aa  96.3  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0421  glycoside hydrolase family 1  25.65 
 
 		 419 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02700  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  24.35 
 
 		 407 aa  94.4  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  36.67 
 
 		 442 aa  94.4  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  22.86 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  23.4 
 
 		 436 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2526  glycoside hydrolase family 1  28.53 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  24.11 
 
 		 452 aa  91.3  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3254  glycoside hydrolase family protein  22.28 
 
 		 447 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0542  glycoside hydrolase family protein  31.82 
 
 		 439 aa  90.1  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294362  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0789  glycoside hydrolase family protein  35.59 
 
 		 443 aa  89.7  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245888  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl425  beta-glucosidase  37.39 
 
 		 452 aa  89  1e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00336379  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  22.72 
 
 		 452 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1944  Beta-glucosidase  22.41 
 
 		 433 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  34.45 
 
 		 413 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  22.19 
 
 		 447 aa  85.9  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0153  Beta-glucosidase  26.7 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  21.52 
 
 		 463 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0511  glycoside hydrolase family 1  23.49 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  21.79 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  0.0000345699 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  22.91 
 
 		 451 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  22.49 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  20.45 
 
 		 460 aa  83.2  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  22.91 
 
 		 451 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  22.31 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  32.94 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  22.74 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  22.7 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  25.18 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  22.63 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  21.39 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  23.42 
 
 		 440 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  22.92 
 
 		 448 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  31.69 
 
 		 485 aa  79  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  22.35 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  28.65 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  23.88 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  22.66 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  27.27 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  22.04 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  22.25 
 
 		 443 aa  76.3  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1558  glycoside hydrolase family protein  23.97 
 
 		 467 aa  75.9  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000340299  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  30.53 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  21.28 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  30.53 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  24.24 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1146  Beta-glucosidase  21.83 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  23.41 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0078  glycoside hydrolase family 1  30.58 
 
 		 465 aa  73.6  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  27.61 
 
 		 472 aa  73.6  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  27.78 
 
 		 456 aa  72  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  30.58 
 
 		 472 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  28.69 
 
 		 475 aa  72.4  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  28.05 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  26.51 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  30.33 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  28.24 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  23.92 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  30.43 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  26.67 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  29.58 
 
 		 478 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1110  glycoside hydrolase family protein  24.89 
 
 		 517 aa  70.9  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  27.85 
 
 		 465 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  29.51 
 
 		 482 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  21.46 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  27.44 
 
 		 468 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  21.3 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  30.71 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  21.79 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  24.37 
 
 		 450 aa  69.7  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  20.48 
 
 		 489 aa  69.3  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  25 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  22.08 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  25.35 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1456  glycoside hydrolase family 1  22.41 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  29.58 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  30.15 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  27.06 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  27.06 
 
 		 474 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4868  beta-galactosidase  26.44 
 
 		 467 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  22.37 
 
 		 488 aa  67.4  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  28.17 
 
 		 479 aa  67.4  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>