More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1456 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1456  glycoside hydrolase family 1  100 
 
 		 430 aa  882    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  27.05 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02700  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  29.62 
 
 		 407 aa  142  8e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2526  glycoside hydrolase family 1  29.72 
 
 		 388 aa  142  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  29.11 
 
 		 417 aa  140  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  28.15 
 
 		 443 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  24.34 
 
 		 442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  29.85 
 
 		 458 aa  132  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  26.83 
 
 		 431 aa  132  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  25.81 
 
 		 432 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0421  glycoside hydrolase family 1  28.44 
 
 		 419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  26.91 
 
 		 462 aa  129  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  27.27 
 
 		 447 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  28.54 
 
 		 463 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  27.16 
 
 		 399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  26.68 
 
 		 431 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  28.51 
 
 		 436 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  27.98 
 
 		 439 aa  122  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4005  glycoside hydrolase family protein  28.64 
 
 		 437 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  25.4 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  27.59 
 
 		 454 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  27.59 
 
 		 458 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0789  glycoside hydrolase family protein  26.25 
 
 		 443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245888  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 411 aa  120  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0657  beta-galactosidase  26.65 
 
 		 445 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.647462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0511  glycoside hydrolase family 1  28.02 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  27.82 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  28.44 
 
 		 458 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4868  beta-galactosidase  24.77 
 
 		 467 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  25.42 
 
 		 451 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0542  glycoside hydrolase family protein  26.86 
 
 		 439 aa  116  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294362  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  28.14 
 
 		 458 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  25.73 
 
 		 471 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2438  glycoside hydrolase family 1  26.45 
 
 		 468 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0255622  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  26.71 
 
 		 470 aa  113  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2741  glycoside hydrolase family 1  26.2 
 
 		 466 aa  112  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137787  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  24.04 
 
 		 475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  25.56 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  27.5 
 
 		 467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  29.22 
 
 		 444 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3254  glycoside hydrolase family protein  26.48 
 
 		 447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  28.5 
 
 		 452 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  28.06 
 
 		 447 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  27.82 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  26.5 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  28.01 
 
 		 467 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  26.88 
 
 		 463 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  28.21 
 
 		 465 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  25.67 
 
 		 476 aa  107  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  29.19 
 
 		 450 aa  106  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  26.37 
 
 		 474 aa  106  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5207  glycoside hydrolase family protein  27.52 
 
 		 471 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226411  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5652  glycoside hydrolase family protein  27.52 
 
 		 471 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0771  glycoside hydrolase family 1  24.69 
 
 		 462 aa  106  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.935854  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  27.21 
 
 		 448 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  25.35 
 
 		 456 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  28.33 
 
 		 445 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  27.89 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  27.8 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0078  glycoside hydrolase family 1  25.81 
 
 		 465 aa  104  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  24.53 
 
 		 438 aa  103  6e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0543  glycoside hydrolase family 1  24.88 
 
 		 462 aa  103  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  26.46 
 
 		 449 aa  103  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  25.87 
 
 		 450 aa  102  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  28.87 
 
 		 489 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  24.89 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0190  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  24.57 
 
 		 497 aa  102  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136833 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1668  glycoside hydrolase family 1  26.03 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.373408  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  23.57 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1944  Beta-glucosidase  28.37 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  25.45 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  25.3 
 
 		 446 aa  102  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  27.55 
 
 		 460 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  26.9 
 
 		 448 aa  101  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  24.49 
 
 		 439 aa  100  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  26.19 
 
 		 453 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2841  glycoside hydrolase family protein  22.58 
 
 		 467 aa  100  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  27.82 
 
 		 457 aa  99.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1407  glycoside hydrolase family 1  25.43 
 
 		 464 aa  99.8  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3935  6-phospho-beta-glucosidase  24.52 
 
 		 470 aa  99.8  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  25.74 
 
 		 472 aa  99.8  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  29 
 
 		 458 aa  99.8  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4246  glycoside hydrolase family 1  25.52 
 
 		 470 aa  99  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  26.76 
 
 		 470 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4230  6-phospho-beta-glucosidase  25.52 
 
 		 464 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4273  glycoside hydrolase family protein  25.52 
 
 		 470 aa  99  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03605  cryptic phospho-beta-glucosidase B  25.52 
 
 		 464 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1705  glycoside hydrolase family 1  24.74 
 
 		 465 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  26.65 
 
 		 463 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  36.53 
 
 		 468 aa  97.4  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  26.16 
 
 		 482 aa  97.1  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4075  glycoside hydrolase family 1  27.6 
 
 		 467 aa  97.1  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0251  glycoside hydrolase family protein  25.95 
 
 		 478 aa  96.7  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0257  glycoside hydrolase family protein  25.95 
 
 		 478 aa  96.7  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  40.25 
 
 		 453 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3603  TonB-like  24.6 
 
 		 461 aa  96.7  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70293  hitchhiker  0.00573623 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  25.06 
 
 		 446 aa  96.3  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  24.61 
 
 		 452 aa  96.3  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0748  glycoside hydrolase family 1  26.45 
 
 		 496 aa  96.3  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  38.36 
 
 		 467 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>