More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_4246 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03605  cryptic phospho-beta-glucosidase B  98.92 
 
 		 464 aa  966    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4246  glycoside hydrolase family 1  100 
 
 		 470 aa  986    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2438  glycoside hydrolase family 1  72.33 
 
 		 468 aa  731    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0255622  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000818  6-phospho-beta-glucosidase  65.73 
 
 		 463 aa  659    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.490689  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06724  phospho-beta-glucosidase B  65.73 
 
 		 463 aa  657    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3935  6-phospho-beta-glucosidase  99.57 
 
 		 470 aa  979    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2741  glycoside hydrolase family 1  72.45 
 
 		 466 aa  736    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137787  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0543  glycoside hydrolase family 1  68.83 
 
 		 462 aa  692    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1668  glycoside hydrolase family 1  73.97 
 
 		 465 aa  742    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.373408  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0771  glycoside hydrolase family 1  68.83 
 
 		 462 aa  693    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.935854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4230  6-phospho-beta-glucosidase  99.35 
 
 		 464 aa  969    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2841  glycoside hydrolase family protein  64.72 
 
 		 467 aa  640    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4273  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 470 aa  986    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1407  glycoside hydrolase family 1  70.28 
 
 		 464 aa  696    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2739  glycoside hydrolase family protein  76.03 
 
 		 465 aa  762    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1705  glycoside hydrolase family 1  73.75 
 
 		 465 aa  742    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0860  beta-glucosidase  57.93 
 
 		 479 aa  569  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0889  glycoside hydrolase family 1  58.35 
 
 		 480 aa  565  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0878  glycoside hydrolase family 6-phospho-beta-glucosidase  57.51 
 
 		 479 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0383438  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2793  glycoside hydrolase family 1  57.87 
 
 		 473 aa  561  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0271062  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0785  glycoside hydrolase family protein  57.53 
 
 		 479 aa  553  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3160  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  54.64 
 
 		 474 aa  545  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3001  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  54.64 
 
 		 474 aa  544  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0996  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  54.22 
 
 		 474 aa  542  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0301517 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3967  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  54.22 
 
 		 474 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02566  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  55.27 
 
 		 474 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0973  glycoside hydrolase family 1  54.22 
 
 		 474 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0791  6-phospho-beta-glucosidase  55.96 
 
 		 475 aa  538  9.999999999999999e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.240964  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2840  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  54.43 
 
 		 474 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.106134 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02531  hypothetical protein  55.27 
 
 		 474 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2852  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  54.22 
 
 		 474 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2547  glycoside hydrolase family 1  54.55 
 
 		 479 aa  537  1e-151  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0806308  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1821  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  54.04 
 
 		 476 aa  538  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.230632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2140  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  54.56 
 
 		 476 aa  533  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.854328  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2481  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  54.35 
 
 		 476 aa  532  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3189  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  54.64 
 
 		 474 aa  533  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0575  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  53.62 
 
 		 476 aa  528  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1352  glycoside hydrolase family 1  54.01 
 
 		 471 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0748  glycoside hydrolase family 1  52.37 
 
 		 496 aa  514  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1103  6-phospho-beta-glucosidase  52.92 
 
 		 478 aa  511  1e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0764  glycoside hydrolase family 1  52.38 
 
 		 489 aa  508  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0902  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  54.02 
 
 		 486 aa  508  9.999999999999999e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0767  glycoside hydrolase family 1  53.47 
 
 		 475 aa  504  1e-141  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0765  6-phospho-beta-glucosidase  52.68 
 
 		 465 aa  497  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0749  glycoside hydrolase family 1  52.68 
 
 		 465 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2500  glycoside hydrolase family protein  52 
 
 		 478 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0968  glycoside hydrolase family 1  50.74 
 
 		 480 aa  487  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1348  glycoside hydrolase family 1  52.06 
 
 		 487 aa  482  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.843045  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3208  6-phospho-beta-glucosidase BglA  51.48 
 
 		 477 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.962709  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3286  6-phospho-beta-glucosidase BglA  51.69 
 
 		 477 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1478  6-phospho-beta-glucosidase  50.74 
 
 		 478 aa  479  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2805  glycoside hydrolase family protein  50.74 
 
 		 478 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3388  6-phospho-beta-glucosidase BglA  51.69 
 
 		 477 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3283  6-phospho-beta-glucosidase BglA  51.69 
 
 		 477 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2729  6-phospho-beta-glucosidase BglA  50.74 
 
 		 478 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.36988  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3220  6-phospho-beta-glucosidase BglA  51.27 
 
 		 477 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.276018 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0791  glycoside hydrolase family 1  51.05 
 
 		 477 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3034  6-phospho-beta-glucosidase BglA  51.48 
 
 		 479 aa  474  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3228  6-phospho-beta-glucosidase BglA  51.05 
 
 		 479 aa  472  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4193  6-phospho-beta-glucosidase BglA  51.48 
 
 		 479 aa  472  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3965  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 487 aa  474  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0808  glycoside hydrolase family protein  51.05 
 
 		 477 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.785665  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02733  6-phospho-beta-glucosidase A  50.63 
 
 		 479 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3060  6-phospho-beta-glucosidase BglA  50.84 
 
 		 479 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1615  6-phospho-beta-glucosidase  50.31 
 
 		 479 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3733  glycoside hydrolase family 1  50.63 
 
 		 478 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1165  6-phospho-beta-glucosidase  50.53 
 
 		 478 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02696  hypothetical protein  50.63 
 
 		 479 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1735  6-phospho-beta-glucosidase  50.31 
 
 		 479 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0012  glycoside hydrolase family 1  49.38 
 
 		 480 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1637  6-phospho-beta-glucosidase  50.62 
 
 		 479 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3322  6-phospho-beta-glucosidase BglA  50.42 
 
 		 479 aa  466  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0224  6-phospho-beta-glucosidase  51.57 
 
 		 480 aa  466  9.999999999999999e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0341  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  51.05 
 
 		 485 aa  466  9.999999999999999e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0011  glycoside hydrolase family 1  49.48 
 
 		 480 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3567  glycoside hydrolase family 1  50 
 
 		 478 aa  467  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3320  glycoside hydrolase family protein  50.63 
 
 		 477 aa  467  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.974893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0469  6-phospho-beta-glucosidase  49.15 
 
 		 478 aa  464  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2987  6-phospho-beta-glucosidase  51.26 
 
 		 476 aa  463  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0783146 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1461  glycoside hydrolase family 1  50.11 
 
 		 478 aa  462  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329338  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3901  glycoside hydrolase family 1  49.69 
 
 		 479 aa  461  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00796853  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0185  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  50.73 
 
 		 496 aa  459  9.999999999999999e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000347604  hitchhiker  0.00387129 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0251  glycoside hydrolase family protein  50.73 
 
 		 478 aa  455  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0257  glycoside hydrolase family protein  50.73 
 
 		 478 aa  455  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0340  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  48 
 
 		 481 aa  457  1e-127  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1668  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  48.57 
 
 		 491 aa  455  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.396346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0927  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  49.05 
 
 		 478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1544  beta-glucosidase  49.69 
 
 		 478 aa  449  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.194171  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl615  beta-glucosidase  46.07 
 
 		 483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1048  glycoside hydrolase family 1  48.45 
 
 		 483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl034  6-phospho-beta-glucosidase  43.21 
 
 		 483 aa  429  1e-119  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0345  6-phospho-beta-glucosidase  46.97 
 
 		 455 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1891  glycoside hydrolase family protein  46.53 
 
 		 483 aa  424  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.001415  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl012  beta-glucosidase  42.92 
 
 		 484 aa  418  9.999999999999999e-116  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0190  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  44.83 
 
 		 497 aa  409  1e-113  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136833 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl430  6-phospho-beta-glucosidase  42.03 
 
 		 480 aa  402  1e-111  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1754  6-phospho-beta-glucosidase  44.42 
 
 		 492 aa  401  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000312177  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl009  beta-glucosidase  42.68 
 
 		 487 aa  386  1e-106  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0942  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  41.91 
 
 		 474 aa  384  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.933475  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3467  glycoside hydrolase family 1  42.05 
 
 		 475 aa  384  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0716612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>