More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0727 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0727  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 357 aa  738    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1708  glycoside hydrolase family protein  72.88 
 
 		 356 aa  580  1e-164  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.913199  normal  0.0276874 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0741  glycoside hydrolase family protein  69.66 
 
 		 358 aa  541  1e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.595255 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0630  glycoside hydrolase family protein  68.17 
 
 		 364 aa  510  1e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  28.03 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  28.79 
 
 		 418 aa  132  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  25.21 
 
 		 432 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  26.19 
 
 		 431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  25.89 
 
 		 431 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  24.86 
 
 		 417 aa  109  8.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  23.89 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4005  glycoside hydrolase family protein  27.19 
 
 		 437 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  23.86 
 
 		 443 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  24.14 
 
 		 452 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  23.69 
 
 		 443 aa  99.4  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0421  glycoside hydrolase family 1  26.16 
 
 		 419 aa  99  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  23.87 
 
 		 470 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  22.74 
 
 		 443 aa  97.4  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02700  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  27.27 
 
 		 407 aa  97.4  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  23.19 
 
 		 427 aa  95.5  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  24.02 
 
 		 449 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0542  glycoside hydrolase family protein  37.4 
 
 		 439 aa  94  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294362  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  23.77 
 
 		 447 aa  93.6  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  23.63 
 
 		 413 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0511  glycoside hydrolase family 1  27.42 
 
 		 401 aa  93.6  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  30.57 
 
 		 427 aa  93.6  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1558  glycoside hydrolase family protein  25.18 
 
 		 467 aa  93.2  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000340299  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  24.8 
 
 		 463 aa  93.2  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  22.81 
 
 		 440 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  24.23 
 
 		 443 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 		 411 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  23.37 
 
 		 452 aa  91.3  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3254  glycoside hydrolase family protein  23.5 
 
 		 447 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  23.94 
 
 		 474 aa  89.7  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  27.32 
 
 		 451 aa  89.7  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  27.32 
 
 		 451 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  22.61 
 
 		 451 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  26.8 
 
 		 451 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0153  Beta-glucosidase  27.43 
 
 		 457 aa  87.4  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0789  glycoside hydrolase family protein  33.86 
 
 		 443 aa  87  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245888  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl425  beta-glucosidase  33.91 
 
 		 452 aa  86.3  7e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00336379  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  22.79 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  22.81 
 
 		 458 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1944  Beta-glucosidase  25.21 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  26.54 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  0.0000345699 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  33.33 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  29.59 
 
 		 462 aa  84.3  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  22.98 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  24.76 
 
 		 439 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2526  glycoside hydrolase family 1  26.4 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  24.94 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  22.88 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  25.07 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  32.39 
 
 		 491 aa  81.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  24.09 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  24.29 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  31.52 
 
 		 485 aa  81.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  25.34 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  30.43 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1146  Beta-glucosidase  25.75 
 
 		 440 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  24.59 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  25.06 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  21.97 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0078  glycoside hydrolase family 1  31.4 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  27.43 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  28.93 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  28.46 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  23.02 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  22.87 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  25.56 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  24.04 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  26.76 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  31.9 
 
 		 472 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  29.37 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  33.33 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  34.43 
 
 		 479 aa  73.6  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  23.22 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  28.21 
 
 		 454 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  27.36 
 
 		 468 aa  73.6  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  20.74 
 
 		 446 aa  73.2  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  30.99 
 
 		 472 aa  73.2  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  19.64 
 
 		 471 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  24.08 
 
 		 448 aa  72.8  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  28.24 
 
 		 448 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  29.01 
 
 		 478 aa  72  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3120  Beta-glucosidase  28.03 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.29426  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  26.32 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  21.13 
 
 		 438 aa  72  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0705  6-phospho-beta-glucosidase  23.78 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76639  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  27.87 
 
 		 468 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000864556  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  27.87 
 
 		 475 aa  70.9  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  27.38 
 
 		 488 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  29.92 
 
 		 484 aa  70.5  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  23.47 
 
 		 455 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl011  beta-glucosidase  25.78 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  28.57 
 
 		 476 aa  70.1  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0652  glycoside hydrolase family protein  22.83 
 
 		 486 aa  69.7  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.000000000739457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  27.1 
 
 		 478 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1210  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  22.75 
 
 		 440 aa  69.3  0.00000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  24.79 
 
 		 451 aa  69.3  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>