299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0630 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0630  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 364 aa  749    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0741  glycoside hydrolase family protein  67.04 
 
 		 358 aa  522  1e-147  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.595255 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0727  glycoside hydrolase family protein  68.17 
 
 		 357 aa  510  1e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1708  glycoside hydrolase family protein  64.12 
 
 		 356 aa  501  1e-141  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.913199  normal  0.0276874 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  28.17 
 
 		 418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  27.25 
 
 		 399 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  29.45 
 
 		 411 aa  116  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4005  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  27.05 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  27.55 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  27.55 
 
 		 431 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  25.14 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0542  glycoside hydrolase family protein  26.45 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294362  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  26.58 
 
 		 449 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  33.12 
 
 		 427 aa  102  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  23.17 
 
 		 427 aa  102  8e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0421  glycoside hydrolase family 1  25.21 
 
 		 419 aa  102  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02700  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  27.71 
 
 		 407 aa  102  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  23.51 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  25.68 
 
 		 443 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  24.48 
 
 		 447 aa  99.8  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  24.68 
 
 		 432 aa  97.4  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  25.63 
 
 		 443 aa  97.1  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  25.75 
 
 		 442 aa  97.1  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  22.98 
 
 		 443 aa  95.5  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  24.71 
 
 		 470 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  23.94 
 
 		 452 aa  95.9  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2526  glycoside hydrolase family 1  27.62 
 
 		 388 aa  94.4  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  27.62 
 
 		 436 aa  93.2  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  22.75 
 
 		 451 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  23.27 
 
 		 451 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  23.27 
 
 		 451 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0789  glycoside hydrolase family protein  31.41 
 
 		 443 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245888  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  24.75 
 
 		 440 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  25.72 
 
 		 435 aa  92  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  0.0000345699 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  23 
 
 		 451 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3254  glycoside hydrolase family protein  24.73 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0511  glycoside hydrolase family 1  26.17 
 
 		 401 aa  89.7  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  24 
 
 		 446 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl425  beta-glucosidase  36.52 
 
 		 452 aa  87.4  4e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00336379  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  24.35 
 
 		 444 aa  86.7  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0153  Beta-glucosidase  26.47 
 
 		 457 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  24.81 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  24.14 
 
 		 463 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  23.12 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  23.16 
 
 		 482 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  23.2 
 
 		 485 aa  81.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  26.86 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  29.73 
 
 		 491 aa  81.3  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  26.56 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0078  glycoside hydrolase family 1  31.94 
 
 		 465 aa  79.7  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  24.27 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  33.1 
 
 		 448 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1146  Beta-glucosidase  23.1 
 
 		 440 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  26.94 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0652  glycoside hydrolase family protein  24.3 
 
 		 486 aa  77.8  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.000000000739457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  24.01 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  24.27 
 
 		 474 aa  75.9  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  23.27 
 
 		 451 aa  76.3  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  21.93 
 
 		 450 aa  76.3  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1558  glycoside hydrolase family protein  23.77 
 
 		 467 aa  75.9  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000340299  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  30.71 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  22.96 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  25 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  20.88 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  22.4 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0344  6-phospho-beta-galactosidase  30.97 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000215907  hitchhiker  0.000984044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  31.62 
 
 		 456 aa  73.2  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  24.3 
 
 		 447 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  23.73 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  22.59 
 
 		 453 aa  73.2  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  32.52 
 
 		 472 aa  72.8  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  28.82 
 
 		 476 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  23.56 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  23.32 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1944  Beta-glucosidase  22.58 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  21.39 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  31.3 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  30.07 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  21.07 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  23.86 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  28.35 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  25 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  30.71 
 
 		 474 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  30.16 
 
 		 482 aa  69.3  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2629  beta-glucosidase  29.73 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  23.31 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  21.96 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  27.5 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  28.87 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0202  Beta-glucosidase  25.85 
 
 		 459 aa  68.9  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  29.58 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  23.33 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  29.51 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  30.89 
 
 		 484 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  28.12 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  29.71 
 
 		 467 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  27.87 
 
 		 475 aa  68.2  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  28.91 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  24.61 
 
 		 450 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>