65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5261 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5261  glycoside hydrolase family 1  100 
 
 		 453 aa  935    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4161  glycoside hydrolase family 1  74.89 
 
 		 451 aa  671    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2019  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  56.8 
 
 		 738 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2008  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  53.27 
 
 		 723 aa  444  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4111  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  50.93 
 
 		 730 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4020  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  50.35 
 
 		 730 aa  437  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20600  glycoside hydrolase family 1  29.5 
 
 		 424 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5470  glycoside hydrolase family 1  30.26 
 
 		 446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3623  glycoside hydrolase family protein  30.95 
 
 		 431 aa  146  9e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.635142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03060  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  30.49 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  24.13 
 
 		 452 aa  74.7  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2701  hypothetical protein  24.39 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0359673 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 		 765 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3624  hypothetical protein  25.56 
 
 		 383 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.183604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  24.59 
 
 		 1293 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2342  hypothetical protein  24.43 
 
 		 380 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0222  amine oxidase  23.66 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0751337  normal  0.686886 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  27.92 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  24.62 
 
 		 463 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  23.49 
 
 		 472 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  21.46 
 
 		 478 aa  54.7  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  23.67 
 
 		 468 aa  53.9  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 		 763 aa  53.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  25.23 
 
 		 491 aa  53.5  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  24.5 
 
 		 417 aa  53.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  25.39 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2841  glycoside hydrolase family protein  21.57 
 
 		 467 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  22.4 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  22.69 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0743  Beta-glucosidase  23.2 
 
 		 475 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  22.39 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2739  glycoside hydrolase family protein  22.54 
 
 		 465 aa  52.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  25.76 
 
 		 439 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1304  beta-glucosidase/6-phospho-beta-glucosidase/ beta -galactosidase  23.66 
 
 		 381 aa  51.6  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3481  glycoside hydrolase family 1  21.6 
 
 		 470 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1944  Beta-glucosidase  30.95 
 
 		 433 aa  50.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2997  Beta-glucosidase  23.12 
 
 		 461 aa  50.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585051  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  24.38 
 
 		 431 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0345  6-phospho-beta-glucosidase  21.17 
 
 		 455 aa  50.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  30.07 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  0.0000345699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  23.61 
 
 		 470 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1456  glycoside hydrolase family 1  28.76 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0979  Beta-glucosidase  23.31 
 
 		 475 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  27.23 
 
 		 468 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  25.15 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  28.27 
 
 		 452 aa  47.8  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  21.86 
 
 		 471 aa  47.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0202  Beta-glucosidase  22.93 
 
 		 459 aa  46.6  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5713  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.12 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal  0.0238528 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  22.99 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  26.09 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  27.21 
 
 		 474 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0153  Beta-glucosidase  20.96 
 
 		 457 aa  44.3  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  22.99 
 
 		 431 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  22.35 
 
 		 485 aa  43.9  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  23.66 
 
 		 472 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27.27 
 
 		 673 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1668  glycoside hydrolase family 1  21.33 
 
 		 465 aa  43.9  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.373408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  23.16 
 
 		 479 aa  43.5  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  20.59 
 
 		 474 aa  43.5  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  23.01 
 
 		 458 aa  43.1  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  22.31 
 
 		 482 aa  43.1  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  22.41 
 
 		 470 aa  43.5  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  25.17 
 
 		 468 aa  43.1  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0086  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  24.39 
 
 		 392 aa  43.1  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.183317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>