234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5470 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5470  glycoside hydrolase family 1  100 
 
 		 446 aa  931    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20600  glycoside hydrolase family 1  32.33 
 
 		 424 aa  209  8e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3623  glycoside hydrolase family protein  30.5 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.635142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5261  glycoside hydrolase family 1  30.26 
 
 		 453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4111  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.88 
 
 		 730 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4020  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.14 
 
 		 730 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03060  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  27.32 
 
 		 433 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2019  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.02 
 
 		 738 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2008  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.01 
 
 		 723 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4161  glycoside hydrolase family 1  25.61 
 
 		 451 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2701  hypothetical protein  28.05 
 
 		 380 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0359673 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0222  amine oxidase  25.18 
 
 		 402 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0751337  normal  0.686886 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1304  beta-glucosidase/6-phospho-beta-glucosidase/ beta -galactosidase  27.04 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  23.71 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2897  hypothetical protein  26 
 
 		 380 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.559953  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  21.63 
 
 		 418 aa  76.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2342  hypothetical protein  27.35 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1193  hypothetical protein  23.13 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.735987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0086  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  26.61 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  21.2 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  24.3 
 
 		 431 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl617  6-phospho-beta-glucosidase  21.58 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3254  glycoside hydrolase family protein  22.22 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 765 aa  63.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  22.87 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  23.8 
 
 		 467 aa  63.2  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl011  beta-glucosidase  22.3 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  24.1 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  28.85 
 
 		 462 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0878  glycoside hydrolase family 6-phospho-beta-glucosidase  22.87 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0383438  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  20.74 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4868  beta-galactosidase  23.36 
 
 		 467 aa  59.7  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  25.61 
 
 		 436 aa  59.7  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  24.02 
 
 		 763 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0860  beta-glucosidase  21.9 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  22.12 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  21.93 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  27.62 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  25.88 
 
 		 517 aa  56.6  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0942  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  22.83 
 
 		 474 aa  56.2  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.933475  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0785  glycoside hydrolase family protein  25.82 
 
 		 479 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  28.1 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3603  TonB-like  27.38 
 
 		 461 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70293  hitchhiker  0.00573623 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  21.03 
 
 		 478 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  23.35 
 
 		 440 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl034  6-phospho-beta-glucosidase  21.35 
 
 		 483 aa  54.3  0.000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0542  glycoside hydrolase family protein  22.98 
 
 		 439 aa  54.3  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294362  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1944  Beta-glucosidase  22.25 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  22.35 
 
 		 444 aa  54.3  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  26.4 
 
 		 443 aa  54.3  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  27.74 
 
 		 472 aa  53.9  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  25 
 
 		 458 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  23.63 
 
 		 440 aa  53.9  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  22.89 
 
 		 435 aa  53.5  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  0.0000345699 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2140  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  21.74 
 
 		 476 aa  53.5  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.854328  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  31.09 
 
 		 471 aa  53.1  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3189  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  22.8 
 
 		 474 aa  53.5  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  28.7 
 
 		 445 aa  53.5  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3160  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  21.71 
 
 		 474 aa  53.1  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  26.79 
 
 		 467 aa  53.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl009  beta-glucosidase  23.16 
 
 		 487 aa  53.1  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl012  beta-glucosidase  20.27 
 
 		 484 aa  52.8  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  24.04 
 
 		 439 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  27.56 
 
 		 452 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3967  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  21.65 
 
 		 474 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0251  glycoside hydrolase family protein  32.14 
 
 		 478 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0257  glycoside hydrolase family protein  32.14 
 
 		 478 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  29.17 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  20.34 
 
 		 452 aa  52.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  19.69 
 
 		 1293 aa  52.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0902  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  26.38 
 
 		 486 aa  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0743  Beta-glucosidase  22.65 
 
 		 475 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  26.11 
 
 		 474 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4005  glycoside hydrolase family protein  23.43 
 
 		 437 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3001  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  21.39 
 
 		 474 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  27.78 
 
 		 459 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2481  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  20.63 
 
 		 476 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0511  glycoside hydrolase family 1  21.39 
 
 		 401 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  27.91 
 
 		 437 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2739  glycoside hydrolase family protein  21.97 
 
 		 465 aa  51.6  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  25.77 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  28.46 
 
 		 470 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2840  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  21.39 
 
 		 474 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.106134 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06724  phospho-beta-glucosidase B  28.19 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0973  glycoside hydrolase family 1  25.7 
 
 		 474 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  20.63 
 
 		 458 aa  51.2  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0996  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  25.7 
 
 		 474 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0301517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2526  glycoside hydrolase family 1  22.94 
 
 		 388 aa  51.2  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2852  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  25.7 
 
 		 474 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  22.62 
 
 		 446 aa  50.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  32 
 
 		 458 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1352  glycoside hydrolase family 1  23.95 
 
 		 471 aa  50.8  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3044  beta-glucosidase  21.88 
 
 		 461 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  23.39 
 
 		 451 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1165  6-phospho-beta-glucosidase  29.31 
 
 		 478 aa  50.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  23.39 
 
 		 451 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  25.2 
 
 		 451 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0791  6-phospho-beta-glucosidase  19.76 
 
 		 475 aa  50.1  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.240964  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  23.75 
 
 		 443 aa  50.1  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1456  glycoside hydrolase family 1  24.56 
 
 		 430 aa  49.7  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>