41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0222 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0222  amine oxidase  100 
 
 		 402 aa  835    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0751337  normal  0.686886 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  39.48 
 
 		 1293 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1193  hypothetical protein  40.27 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.735987 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2701  hypothetical protein  37.84 
 
 		 380 aa  239  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0359673 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  38.52 
 
 		 765 aa  236  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3624  hypothetical protein  37.27 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.183604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1304  beta-glucosidase/6-phospho-beta-glucosidase/ beta -galactosidase  38.94 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2342  hypothetical protein  37.87 
 
 		 380 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0301397 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  36.34 
 
 		 763 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2897  hypothetical protein  39.22 
 
 		 380 aa  217  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.559953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0086  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  36.18 
 
 		 392 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5470  glycoside hydrolase family 1  25.55 
 
 		 446 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20600  glycoside hydrolase family 1  23.16 
 
 		 424 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3623  glycoside hydrolase family protein  23.39 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.635142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5261  glycoside hydrolase family 1  23.66 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2019  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25 
 
 		 738 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03060  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  24.5 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4161  glycoside hydrolase family 1  27.3 
 
 		 451 aa  59.7  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4111  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  24.8 
 
 		 730 aa  57  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2008  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.95 
 
 		 723 aa  53.5  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3467  glycoside hydrolase family 1  22.15 
 
 		 475 aa  53.1  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0716612  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0257  glycoside hydrolase family protein  22.87 
 
 		 478 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0251  glycoside hydrolase family protein  22.87 
 
 		 478 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0469  6-phospho-beta-glucosidase  21.98 
 
 		 478 aa  49.7  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  21.16 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  27.35 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0791  glycoside hydrolase family 1  22.53 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0808  glycoside hydrolase family protein  22.53 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.785665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0340  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  22.8 
 
 		 481 aa  45.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3388  6-phospho-beta-glucosidase BglA  22.05 
 
 		 477 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3283  6-phospho-beta-glucosidase BglA  22.05 
 
 		 477 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3286  6-phospho-beta-glucosidase BglA  22.05 
 
 		 477 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  26.02 
 
 		 474 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3228  6-phospho-beta-glucosidase BglA  22.53 
 
 		 479 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3060  6-phospho-beta-glucosidase BglA  22.53 
 
 		 479 aa  44.3  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3208  6-phospho-beta-glucosidase BglA  22.05 
 
 		 477 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.962709  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3481  glycoside hydrolase family 1  22.48 
 
 		 470 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3567  glycoside hydrolase family 1  21.53 
 
 		 478 aa  43.5  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02696  hypothetical protein  22.22 
 
 		 479 aa  43.1  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3220  6-phospho-beta-glucosidase BglA  22.05 
 
 		 477 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.276018 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02733  6-phospho-beta-glucosidase A  22.22 
 
 		 479 aa  43.1  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>