288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3737 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3737  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  100 
 
 
466 aa  937    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  31.12 
 
 
460 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  34.66 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  29.12 
 
 
363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000245782  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  28.27 
 
 
617 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  29.39 
 
 
381 aa  123  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.91 
 
 
379 aa  121  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.26 
 
 
436 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  30.03 
 
 
398 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  27.48 
 
 
371 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  30.12 
 
 
418 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.82 
 
 
371 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3326  glucose sorbosone dehydrogenase  29.91 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1756  L-sorbosone dehydrogenase  28.46 
 
 
408 aa  118  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.78127  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  30.86 
 
 
396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.39 
 
 
362 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3898  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.82 
 
 
391 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  25.97 
 
 
642 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  25 
 
 
411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  27.81 
 
 
410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2815  hypothetical protein  27.67 
 
 
363 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2684  hypothetical protein  27.67 
 
 
363 aa  114  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2218  NHL repeat-containing protein  27.53 
 
 
430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.493276  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.2 
 
 
361 aa  114  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.57 
 
 
367 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0550  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.35 
 
 
388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  29.46 
 
 
384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.61 
 
 
403 aa  110  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.61 
 
 
403 aa  110  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0874  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  29.11 
 
 
357 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159521  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3219  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.65 
 
 
386 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00839547  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  27.14 
 
 
363 aa  109  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  28.61 
 
 
391 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3230  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.94 
 
 
391 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.400562  hitchhiker  0.00000328613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0759  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.94 
 
 
391 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608473  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.07 
 
 
390 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.07 
 
 
390 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0731  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.57 
 
 
391 aa  107  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000431529 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1065  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  28.72 
 
 
380 aa  106  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  26.38 
 
 
357 aa  106  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0787  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.78 
 
 
390 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  30.77 
 
 
377 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  28.53 
 
 
369 aa  104  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0812  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.49 
 
 
390 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0774  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.32 
 
 
391 aa  103  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250675  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  28.53 
 
 
369 aa  103  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0780  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.9 
 
 
387 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.695554  hitchhiker  0.00000105496 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4189  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.49 
 
 
373 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2860  L-sorbosone dehydrogenase  29.19 
 
 
389 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2921  L-sorbosone dehydrogenase  29.19 
 
 
372 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2969  hypothetical protein  29.19 
 
 
355 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1005  putative membrane-bound dehydrogenase  28.16 
 
 
394 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  27.95 
 
 
394 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0356498 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.14 
 
 
379 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2660  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.67 
 
 
388 aa  100  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  29.45 
 
 
379 aa  100  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2788  NHL repeat-containing protein  27.75 
 
 
349 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2235  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.7 
 
 
379 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1660  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.9 
 
 
419 aa  97.8  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3557  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.9 
 
 
380 aa  97.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.683195  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  28.65 
 
 
424 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  28.49 
 
 
380 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1027  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.73 
 
 
379 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0589  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  30.07 
 
 
379 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  27.35 
 
 
371 aa  94.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1068  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.07 
 
 
379 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310832  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0900  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  25.73 
 
 
361 aa  94  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1588  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  26.63 
 
 
419 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  29.54 
 
 
1439 aa  92.4  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3042  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.84 
 
 
391 aa  91.3  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4182  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  28.45 
 
 
379 aa  90.9  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3094  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.76 
 
 
427 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.379716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0809  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  25.84 
 
 
417 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  26.51 
 
 
546 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0024  hypothetical protein  23.97 
 
 
379 aa  87  6e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0783  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.99 
 
 
466 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.194417 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0619  putative L-sorbosone dehydrogenase  25 
 
 
417 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1425  putative L-sorbosone dehydrogenase  25.89 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0311  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  24.72 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.654077 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  29.75 
 
 
1110 aa  82.4  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0496  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  26.09 
 
 
428 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0409715  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2145  L-sorbosone dehydrogenase  26.52 
 
 
423 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1682  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  25.2 
 
 
428 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0287  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  25.69 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.473358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0146  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  26.81 
 
 
438 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.699108  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0920  L-sorbosone dehydrogenase  28.52 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2082  putative sorbosone/glucose dehydrogenase  27.72 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.04 
 
 
1274 aa  80.5  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2546  glucose/sorbosone dehydrogenases  28.52 
 
 
299 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.454169  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0415  NHL repeat-containing protein  26.88 
 
 
416 aa  79.7  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.96309  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  25.9 
 
 
448 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0134  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.62 
 
 
427 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0143  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.62 
 
 
427 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0124  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.62 
 
 
427 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1623  L-sorbosone dehydrogenase  25.21 
 
 
420 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.417413 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0697  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  27.73 
 
 
443 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0148  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  24.38 
 
 
423 aa  76.6  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.392107 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  25.38 
 
 
1058 aa  76.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  22.75 
 
 
433 aa  75.1  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  24.53 
 
 
438 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>