209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2343 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  100 
 
 
512 aa  1031    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  42.86 
 
 
513 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  46.47 
 
 
506 aa  331  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  45.17 
 
 
500 aa  330  4e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  41.25 
 
 
501 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  44.25 
 
 
518 aa  324  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  41.05 
 
 
501 aa  322  7e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  41.05 
 
 
501 aa  322  7e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  45.08 
 
 
515 aa  319  6e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  43.24 
 
 
509 aa  319  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  42.07 
 
 
512 aa  317  3e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  44.03 
 
 
512 aa  312  9e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  41.65 
 
 
536 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  44.65 
 
 
510 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  41.44 
 
 
535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  44.44 
 
 
548 aa  307  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  41.63 
 
 
534 aa  306  6e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  42.7 
 
 
502 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0793  Aminopeptidase Y  43.13 
 
 
514 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  42.86 
 
 
481 aa  294  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  44.8 
 
 
512 aa  295  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3548  aminopeptidase Y  42 
 
 
555 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0650469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  39.95 
 
 
488 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  41.76 
 
 
512 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  39.86 
 
 
503 aa  270  5.9999999999999995e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0554  aminopeptidase Y  40.7 
 
 
479 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0566  aminopeptidase Y  40.7 
 
 
479 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0537512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0544  aminopeptidase Y  40.7 
 
 
479 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.282981  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  38.36 
 
 
488 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  41.51 
 
 
524 aa  261  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.481582 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03918  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00220)  38.14 
 
 
502 aa  238  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  51.85 
 
 
502 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  34.27 
 
 
533 aa  228  3e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  49 
 
 
519 aa  216  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  48.61 
 
 
518 aa  216  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  44.35 
 
 
312 aa  187  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  43.6 
 
 
1147 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  41.2 
 
 
1077 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  41.63 
 
 
947 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  41.63 
 
 
1131 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  40.78 
 
 
291 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  39.73 
 
 
437 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  38.76 
 
 
313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  37.72 
 
 
309 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  30.13 
 
 
391 aa  113  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  27.63 
 
 
466 aa  106  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5481  putative aminopeptidase  27.37 
 
 
466 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  28.57 
 
 
466 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  28.88 
 
 
465 aa  98.6  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5488  aminopeptidase, putative  27.85 
 
 
466 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  27.85 
 
 
466 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5537  putative aminopeptidase  28.02 
 
 
466 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  27.85 
 
 
466 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5040  aminopeptidase  27.85 
 
 
466 aa  93.2  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  28.18 
 
 
454 aa  93.2  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5208  aminopeptidase  27.6 
 
 
466 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0274505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  27.6 
 
 
466 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  27.83 
 
 
450 aa  90.1  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  27.38 
 
 
456 aa  85.9  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  26.77 
 
 
584 aa  85.5  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  26.93 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  27.78 
 
 
454 aa  83.6  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0415  peptidase M28  27.74 
 
 
440 aa  82  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  31.25 
 
 
436 aa  80.9  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2848  aminopeptidase  25.2 
 
 
457 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000136315 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5675  peptidase M28  25.34 
 
 
457 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555231 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  26.97 
 
 
447 aa  78.2  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  25.36 
 
 
487 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  36.72 
 
 
539 aa  75.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  26.36 
 
 
571 aa  74.3  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  27.65 
 
 
440 aa  73.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  26.9 
 
 
497 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  27.41 
 
 
944 aa  70.5  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  28.57 
 
 
416 aa  70.1  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  25.74 
 
 
459 aa  69.7  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0809  peptidase M28  30.48 
 
 
625 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  26.03 
 
 
479 aa  68.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  29.31 
 
 
468 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  29.96 
 
 
578 aa  67.4  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  29.31 
 
 
468 aa  67  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  28.51 
 
 
775 aa  66.6  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  34.42 
 
 
525 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  28.97 
 
 
468 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  30.34 
 
 
468 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  29.31 
 
 
468 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  28.78 
 
 
544 aa  64.3  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  28.87 
 
 
468 aa  64.3  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2289  peptidase M28  44.55 
 
 
338 aa  64.3  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  29.18 
 
 
468 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  22.77 
 
 
525 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  28.77 
 
 
472 aa  62.4  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  24.41 
 
 
462 aa  61.6  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  27.68 
 
 
469 aa  60.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  36.15 
 
 
647 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  23.91 
 
 
420 aa  60.5  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  26.21 
 
 
466 aa  59.7  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  33.87 
 
 
1247 aa  59.7  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  28.32 
 
 
481 aa  58.9  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  30.56 
 
 
424 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  35.38 
 
 
647 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>