22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04410 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04410  hypothetical protein  100 
 
 
501 aa  1023    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04405  hypothetical protein  48.61 
 
 
469 aa  429  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04415  hypothetical protein  49.35 
 
 
424 aa  387  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0155  hypothetical protein  35.44 
 
 
538 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.781085  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07181  conserved hypothetical protein  36.76 
 
 
452 aa  252  9.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882964  normal  0.428749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1229  PKD domain-containing protein  34.5 
 
 
675 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.12 
 
 
913 aa  204  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.02 
 
 
911 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1588  HAD family hydrolase  31.2 
 
 
835 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570612  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0046  putative secreted protein  26.47 
 
 
636 aa  55.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  39.77 
 
 
2239 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02230  metalloprotease, putative  37.21 
 
 
927 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493351  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0788  LVIVD repeat-containing protein  23.12 
 
 
645 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0658316  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  35.96 
 
 
1093 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  28.74 
 
 
669 aa  49.3  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6147  putative secreted protein  22.37 
 
 
450 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0413388 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07560  thermolysin precursor  27.32 
 
 
1250 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  27.96 
 
 
887 aa  45.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3393  putative secreted protein  25.57 
 
 
471 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327426  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  27.64 
 
 
617 aa  43.5  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0894  hypothetical protein  23.89 
 
 
405 aa  43.5  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.707456  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  30.23 
 
 
654 aa  43.5  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>