65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1229 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1229  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 675 aa  1394    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.42 
 
 		 913 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.03 
 
 		 911 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1588  HAD family hydrolase  38.68 
 
 		 835 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04415  hypothetical protein  37.75 
 
 		 424 aa  258  3e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04405  hypothetical protein  37.13 
 
 		 469 aa  254  3e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04410  hypothetical protein  34.27 
 
 		 501 aa  223  7e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0155  hypothetical protein  31.14 
 
 		 538 aa  212  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.781085  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07181  conserved hypothetical protein  29.45 
 
 		 452 aa  177  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882964  normal  0.428749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1232  PKD domain-containing protein  38.64 
 
 		 2706 aa  64.7  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3649  fibronectin type III domain-containing protein  37.14 
 
 		 700 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.483287  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  45.05 
 
 		 1667 aa  54.3  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  47.89 
 
 		 816 aa  51.2  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0046  putative secreted protein  23.76 
 
 		 636 aa  50.8  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  47.62 
 
 		 3295 aa  50.8  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  22.76 
 
 		 4231 aa  49.7  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  50 
 
 		 712 aa  49.7  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  46.03 
 
 		 871 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  40 
 
 		 1057 aa  49.3  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0124  peptidase M6 immune inhibitor A  48.21 
 
 		 867 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  38.32 
 
 		 1842 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  48.33 
 
 		 2272 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  51.92 
 
 		 1029 aa  48.9  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  48.39 
 
 		 1732 aa  48.1  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  38.2 
 
 		 1389 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  43.06 
 
 		 935 aa  47.8  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4230  peptidase M6, immune inhibitor A  42.86 
 
 		 871 aa  47.8  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187448  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  34.21 
 
 		 552 aa  47.8  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  44.71 
 
 		 2554 aa  47.8  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  40.68 
 
 		 642 aa  47.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  37.11 
 
 		 818 aa  47  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  35.23 
 
 		 780 aa  47  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0128  M6 family metalloprotease domain protein  44.64 
 
 		 865 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  39.68 
 
 		 1167 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  50 
 
 		 1916 aa  47  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  44.12 
 
 		 734 aa  46.2  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  28.75 
 
 		 1194 aa  46.2  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  43.02 
 
 		 1565 aa  46.6  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  37.88 
 
 		 317 aa  46.6  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1375  MoxR-like ATPases-like  32.61 
 
 		 1238 aa  46.2  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00027114  hitchhiker  0.0024969 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3394  secreted protein  23.31 
 
 		 470 aa  46.6  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  38.78 
 
 		 1969 aa  45.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  29.55 
 
 		 1222 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  41.94 
 
 		 960 aa  45.8  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  34.95 
 
 		 1150 aa  45.8  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  41.94 
 
 		 960 aa  45.8  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  33.65 
 
 		 1862 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  45.9 
 
 		 910 aa  45.8  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  45 
 
 		 938 aa  45.8  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3437  PKD domain containing protein  42.86 
 
 		 487 aa  45.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.639471  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  47.54 
 
 		 869 aa  45.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0828059  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  40.32 
 
 		 960 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  36.71 
 
 		 1441 aa  45.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  45 
 
 		 2000 aa  44.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  39.71 
 
 		 623 aa  44.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.35 
 
 		 836 aa  44.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.62 
 
 		 942 aa  44.7  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  48.21 
 
 		 517 aa  44.7  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  43.33 
 
 		 575 aa  44.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  42.86 
 
 		 1094 aa  44.3  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.07 
 
 		 2096 aa  44.3  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0788  LVIVD repeat-containing protein  23.47 
 
 		 645 aa  44.3  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0658316  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3395  secreted protein  22.03 
 
 		 458 aa  43.9  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.201979  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  45.45 
 
 		 936 aa  43.9  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  42.17 
 
 		 2066 aa  43.9  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>