23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6147 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6147  putative secreted protein  100 
 
 
450 aa  920    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0413388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3395  secreted protein  58.69 
 
 
458 aa  498  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.201979  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2253  LVIVD repeat-containing protein  55.91 
 
 
480 aa  487  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2058  putative secreted protein  55.56 
 
 
480 aa  488  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2110  LVIVD repeat-containing protein  55.68 
 
 
481 aa  481  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554457  normal  0.0831107 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3394  secreted protein  55.22 
 
 
470 aa  476  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118882  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1396  putative secreted protein  57.64 
 
 
460 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1395  putative secreted protein  54.97 
 
 
486 aa  472  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3393  putative secreted protein  55.32 
 
 
471 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327426  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0046  putative secreted protein  45.83 
 
 
636 aa  340  2.9999999999999998e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0316  LVIVD repeat protein  28.02 
 
 
466 aa  54.7  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3068  LVIVD repeat protein  24.34 
 
 
472 aa  54.3  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6267  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.23 
 
 
658 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.62 
 
 
913 aa  52.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0173  hypothetical protein  24.29 
 
 
459 aa  52.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.500875  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2512  LVIVD repeat protein  25.91 
 
 
518 aa  50.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.663749  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.26 
 
 
911 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04410  hypothetical protein  22.37 
 
 
501 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6317  hypothetical protein  32.14 
 
 
476 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0788  LVIVD repeat-containing protein  34.78 
 
 
645 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0658316  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5158  hypothetical protein  26.36 
 
 
417 aa  45.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1138  hypothetical protein  25.96 
 
 
446 aa  44.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5196  hypothetical protein  29.56 
 
 
645 aa  43.1  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0675413  normal  0.16071 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>