19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3393 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3394  secreted protein  74.63 
 
 		 470 aa  709    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3393  putative secreted protein  100 
 
 		 471 aa  961    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3395  secreted protein  68.4 
 
 		 458 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.201979  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1396  putative secreted protein  58.09 
 
 		 460 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2058  putative secreted protein  56.71 
 
 		 480 aa  478  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1395  putative secreted protein  54.81 
 
 		 486 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2110  LVIVD repeat-containing protein  54.09 
 
 		 481 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554457  normal  0.0831107 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2253  LVIVD repeat-containing protein  54.21 
 
 		 480 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6147  putative secreted protein  54.37 
 
 		 450 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0413388 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0046  putative secreted protein  44.4 
 
 		 636 aa  337  1.9999999999999998e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04405  hypothetical protein  22.56 
 
 		 469 aa  68.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25 
 
 		 913 aa  60.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.32 
 
 		 911 aa  55.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04415  hypothetical protein  24.87 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1588  HAD family hydrolase  26.14 
 
 		 835 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2512  LVIVD repeat protein  25.85 
 
 		 518 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.663749  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0173  hypothetical protein  33 
 
 		 459 aa  46.6  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.500875  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6317  hypothetical protein  27.12 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04410  hypothetical protein  25.57 
 
 		 501 aa  44.7  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>