12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2253 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2110  LVIVD repeat-containing protein  91.46 
 
 		 481 aa  867    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554457  normal  0.0831107 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2253  LVIVD repeat-containing protein  100 
 
 		 480 aa  992    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2058  putative secreted protein  63.85 
 
 		 480 aa  598  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1396  putative secreted protein  63.68 
 
 		 460 aa  548  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1395  putative secreted protein  60.59 
 
 		 486 aa  530  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3394  secreted protein  56.22 
 
 		 470 aa  528  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3395  secreted protein  54 
 
 		 458 aa  488  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.201979  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6147  putative secreted protein  56.71 
 
 		 450 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0413388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3393  putative secreted protein  55.19 
 
 		 471 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0046  putative secreted protein  45.78 
 
 		 636 aa  366  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0173  hypothetical protein  22.22 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.500875  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3068  LVIVD repeat protein  24.8 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>