17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2058 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2058  putative secreted protein  100 
 
 		 480 aa  991    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2253  LVIVD repeat-containing protein  67.44 
 
 		 480 aa  592  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2110  LVIVD repeat-containing protein  67.21 
 
 		 481 aa  590  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554457  normal  0.0831107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1396  putative secreted protein  64.33 
 
 		 460 aa  574  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1395  putative secreted protein  62.17 
 
 		 486 aa  555  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3394  secreted protein  57.81 
 
 		 470 aa  511  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3395  secreted protein  55.05 
 
 		 458 aa  485  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.201979  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6147  putative secreted protein  56.05 
 
 		 450 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0413388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3393  putative secreted protein  56.71 
 
 		 471 aa  475  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0046  putative secreted protein  45.01 
 
 		 636 aa  336  5.999999999999999e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0173  hypothetical protein  22.47 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.500875  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5158  hypothetical protein  26.99 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  22.59 
 
 		 911 aa  47.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4367  protease domain-containing protein  30.68 
 
 		 583 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000129346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.75 
 
 		 865 aa  44.3  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04405  hypothetical protein  22.06 
 
 		 469 aa  44.3  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.21 
 
 		 913 aa  43.5  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>