15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1395 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1395  putative secreted protein  100 
 
 		 486 aa  1004    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1396  putative secreted protein  72.28 
 
 		 460 aa  664    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2058  putative secreted protein  62.17 
 
 		 480 aa  569  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2253  LVIVD repeat-containing protein  60.95 
 
 		 480 aa  543  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2110  LVIVD repeat-containing protein  59.95 
 
 		 481 aa  525  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554457  normal  0.0831107 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3394  secreted protein  56.16 
 
 		 470 aa  526  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3395  secreted protein  52.92 
 
 		 458 aa  486  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.201979  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6147  putative secreted protein  55.02 
 
 		 450 aa  471  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0413388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3393  putative secreted protein  55.07 
 
 		 471 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0046  putative secreted protein  43.54 
 
 		 636 aa  348  1e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0173  hypothetical protein  23.21 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.500875  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.25 
 
 		 913 aa  47.4  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.5 
 
 		 911 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4367  protease domain-containing protein  26.09 
 
 		 583 aa  43.9  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000129346  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1138  hypothetical protein  24.9 
 
 		 446 aa  43.5  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>